[
b]تقسيم البكتريا Taxonomy of Bacteria
بالرغم من أن تسمية وتصنيف البكتيريا تعتبر أحد الفروع الهامة في البكتيريولوجي Bacteriology إلا أنها لا تجذب الكثير من المشتغلين بهذا العلم .
وعلم التقسيم عموماً هو ذلك العلم أو الفرع من علوم الحياة الذي يختص بإطلاق الأسماء على الحيوانات أو النباتات أو غيرها من الكائنات الحية وتنظيمها في مجاميع تبعاً للعلاقة الطبيعية المتواجدة بينها وفي الدراسات البيولوجية لا يمكن الفصل بين التسمية Nomenclature والتصنيف Classification حيث يعتمد كل منهما على الآخر . فمثلاً لو أطلق اسم غير مناسب على كائن بكتيري فإنه يصعب تصنيفه ووضعه في مكانه الطبيعي بين البكتريا الأخرى والعكس يكون صحيحاً .
وأحد أهداف التقسيم هو اكتشاف العلاقة بين الكائنات الحية ويجب أن نفرق بين علم التقسيم Taxonomy وعلم التعرف Identification على الأحياء .
فعلم التقسيم هو محاولة ترتيب الأحياء وفقاً لاختلافها .
وعلم التعرف على الأحياء هو عبارة
عن التعرف على الأحياء تحت الدراسة ومدى مشابهتها للكائنات في أي قسم من الأقسام التي تم وضعها في علم التقسيم . ويجب ألا نخلط بين هذين التعريفين بالتسمية فهي وضع اسم لكائن حي .
ومن ذلك نرى أن التقسيم Taxonomy يشمل عمليتين هي :-
الأولى :- التسمية Nomenclature
الثانية :- التصنيف Classification أو التبويب .
عرف علم التقسيم Taxonomy ؟
عرف علم التعريف Identification ؟
عرف التسمية Nomenclature ؟
أولاً :- تسمية البكتيريا :
أن التاريخ القديم يبين محاولة العلماء لتسمية الكائنات الحية فقد قام ارسطو 384-322 قبل الميلاد بجمع نباتات عديدة مختلفة محاولاً تسميتها وتقسيمها وتبعه بعد ذلك عدة محاولات إلى أن جاء العالم السويدي Carl Ven Linne 1753 بوضع نظام التسمية المزدوج Binomial System لتسمية النباتات . ثم اقتبس هذا النظام فيما بعد لتسمية الحيوانات والكائنات الدقيقة . ولازال مستعملاً إلى الآن .
ولما كانت البكتيريا تمتلك صفات كل من النباتات والحيوانات الأمر الذي أدى إلى ارتباك العلماء في اتباع الكود النباتي ( القوانين واللوائح الخاصة بتسمية وتقسيم النباتات ) أو اتباع الكود الحيواني لتسمية البكتريا وتقسيمها . وفي عام 1903 اصطلح على استخدام الكود النباتي لتسمية وتقسيم البكتيريا . وفي عام 1947 انشيء أول كود بكتيريولوجي International bacteriology Code اثناء انعقاد الجمعية الميكروبيولوجية الدولية في كوبنهاجن بالدنمارك .
يعتبر نظام التسمية المزدوج Binomial System الذي وضعه لعالم السويدي Carl Ven Linne 1753م اول نظام تقسيمي تم تطبيقه في تسمية النباتات ثم اقتبس هذا النظام فيما بعد لتسمية الحيوانات والكائنات الدقيقة
إتفق علماء التقسيم باستخدام النظم المتبعة لتسمية النباتات في تسمية البكتيريا وذلك لوجود بعض الصفات المتشابهة بين النباتات والبكتيريا.
الأسماء العلمية Scientific names
لكل كائن حي نوعان من الأسماء ، أسماء دارجة Common أو Vernical أو Trival وهذه الأسماء الدارجة تختلف من مكان إلى آخر فمثلاً البكتيريا التي تسبب مرض التيفود يشار إليها باللغة الإنجليزية Typhoid bacillus وبالألمانية Typhus bazilen وبالفرنسية Bacille typhique وتستعمل هذه الأسماء الدارجة وهي ذات طابع محلي عادة لغرض التبيسط بدلاً من استعمال الأسماء العلمية المعقدة والطويلة .
والنوع الآخر من التسمية هو التسمية العلمية Scientific names أو Collequial names وهي الأسماء ذات الطابع الدولي يستعملها العلماء . جميعاً مهما اختلفت لغاتهم ، وتكوين هذا الإسم من الأسماء يراعى فيه نظام معين متفق عليه دولياً طبقاً للمباديء والقوانين التي جاءت في الكود البكتيريولوجي المقترح عام 1947م ويشمل هذا الكود مجموعة من اللوائح والتوصيات والتي تشبه كثيراً تلك الخاصة بالكود النباتي إلا أنها تختلف في بعض التفاصيل .
أذكر مثال للأسماء الدارجة للبكتيريا؟
الكود البكتيريولوجي المقترح عام 1947م يشمل مجموعة من اللوائح والتوصيات والتي تشبه كثيراً تلك الخاصة بالكود النباتي إلا أنها تختلف في بعض التفاصيل
ومن الأساسيات العامة في تسمية البكتيريا علمياً ما يلي :ـ
1- البكتيريا المتشابهة والمتطابقة تماماً تكون ما يسمى بالنوع Species .
2- تبعاً لنظام التسمية المزدوجة binomial فإن كل نوع بكتيري يطلق عليها اسم مكون من كلمتين كل منهما يجب أن تكون لاتينية أو يونانية الأصل وإن لم تكن كذلك يجب أن تعامل معاملة لاتينية أو يونانية.
يكتب عادة أول حرف من الكلمة الأولى وهي تشير إلى اسم الجنس Genus وقد يكون اسم الجنس المستعمل مذكراً أو مؤنثاً أو محايداً . فمثلاً الإسم Lactobacillus لاتيني الأصل ( مذكرًا ) الإسم Sarcina لاتيني الأصل مؤنثاً وMicrococcus يوناني الأصل مذكراً Corynebacterium يوناني الأصل محايداً Clostridium يوناني الأصل محايداً . وهكذا
وبعض الأسماء لأجناس معينة قد تكون أسماء لبعض الأشخاص تخليداً لذكراهم وفي هذه الحالة يجب أن يعامل الأسم معاملة لاتينية مثل Pasteurella تخليداً ( لذكرى باستير ) وNeisseria تخليداً ( لذكرى A.neisser )
والكلمة الثانية في الإسم العلمي تشير إلى النوع البكتيري وتعرف بSpecies وهذه لايكون حرفها الأول كبير إلا أنها عادة تكون :-
1- صفة تتأثر بالإسم السابق لها بمعنى أنها تتبعه في الدرجة كماSarcina alba
2- صفة في صورة فعل مضارع مثل Clostridium dissolves
3- أو تكون الكلمة الثانية المكونة للإسم العلمي عبارة عن اسم يعطي معنى التملك مثل Streptococcus/actis
4- أن يكون اسماً للتوضيح بمعنى يوضح طبيعة الإسم السابق لهActinomyces Scabies
ويمكن إضافة كلمة ثالثة إلى الأسم العلمي الثنائي ليشير إلى مؤلف الأسم الثنائي وليس إلى مكتشف الميكروب كما قد يعتقد البعض مثل : Bacillus Subtilis Cohn و Bacillus Coagulans Hammer
وأحياناً تشاهد أكثر من كلمة واحدة عقب الأسم العلمي الثنائي تكون الأولى منها بين قوسين مثل : Staphylococcus aureus (Rosenbach) Winslow & Rogers . وهذا يعني أن Rosenbach هو أول من سمى هذا الميكروب وأعطاه الأسم النوعي Species ولكن كان وضعه تحت جنس آخر الا أن Winslow & Rogers هما اللذان وضعا هذا النوع تحت الجنس Staphylococcus
أحياناً يقسم النوع إلى أصناف أو سلالات Varieties or Strains وهذا يحدث عندما تتواجد اختلافات بسيطة بين أفراد النوع لا تكفي لوضعها في نوع مستقل . فمثلا ًسلالة البكتيريا Streptococcus Lactis والتي تعطي اللبن طعم الشعيرتعرف بالإسم :- Strept . Lactis Var . maltige
من الأساسيات العامة في تسمية البكتيريا علمياً تكون البكتيريا المتشابهة والمتطابقة تماماً تكون ما يسمى بالنوع Species .
تقسيم البكتيريا Classification of Bacteria
يعتمد تقسيم البكتيريا على العلاقة بينهما أو بمعنى آخر كثرة أو قلة التشابه بينهما وتوجد أساليب مختلفة لتحديد درجة التشابه بين البكتيريا المختلفة من الصفات الظاهرية ( المورفولوجيه) والفسيولوجية والمزرعية والمصلية والمرضية والبيئية وغيرها .
ولا يوجد إتفاق تام على الأهمية النسبية لكل نوع من الصفات في تقسيم البكتيريا . وكثيراً ما تعطي صفة معينة أهمية على غيرها من الصفات للحصول على تقسيم طبيعي Natural Classification أو تقسيم تطوري Phylogenetic Classification للبكتيريا يوضح علاقة البكتيريا ببعضها على أساس منشأها المحتمل وتطورها . إذ يجمع البكتيريا ذات المنشأ المشترك مع بعضها البعض أكثر من تلك التي تختلف في المنشأ . ويمكن الوصول لمثل ذلك التقسيم لو توفرت معلومات كافية عن سائر البكتيريا والحلقات المفقودة بينهما ولكن ذلك غير متوفر حاليأ .ولذلك فبناء مثل ذلك التقسيم من الصعوبة بمكان في الوقت الحالي .
التقسيم الطبيعي للبكتيريا :-
يعتمد تقسيم البكتيريا على العلاقة بينهما أو بمعنى آخر كثرة أو قلة التشابه بينهما وتوجد أساليب مختلفة لتحديد درجة التشابه بين البكتيريا المختلفة من الصفات الظاهرية والصفات الأخرى والتي أشير إليها سابقاً .
التقسيم الاصطناعي للبكتيريا :-Artificial System
ولذلك يستخدم نوع آخر من التقسيم يسمى التقسيم الاصطناعي أو التقسيم الشكلي وهو يعتمد على صفات يسهل ملاحظتها .
وهذا التقسيم ذو فائدة عملية لتعريف البكتيريا غير المعروفة بالإضافة إلى أنه يبين العلاقات بين هذه الأحياء الدقيقة . وتعتمد طبيعة هذه العلاقات على المعاييرالمستعملة لتكوين هيكل التقسيم . وبحكم الحاجة نشأ تقسيم البكتيريا على هذا الأساس . فمثلاً يمكن الاستنتاج أن البكتيريا الكروية قريبة من بعضها البعض وأنها نشأت ووضعت مع بعضها البعض منفصلة عن البكتيريا العصوية أو الحلزونية أو الخيطية .
التقسيم العددي للبكتيريا Numerical Taxonomy
نظراً لعدم إمكانية بناء تقسيم طبيعي للبكتيريا لقلة المعلومات المتوفرة عنها وعن الحلقات المفقودة فيما بينها ، ونظراً لعدم كفاية التقسيم الاصطناعي أو الشكلي للبكتيريا لوضع هيكل تقسيمي ثابت ودائم ، فالقيمة التقسيمية للصفات المختلفة في التقسيم الاصطناعي تتغير من وقت لآخر حسب الاكتشافات المستمرة .
لذلك نشأ نوع آخر من التقسيم يسمى التقسيم العددي Numerical Taxonomy وهو يأخذ في الحسبان كل الإختلافات بنفس القيمة التقسيمية . ومما سهل إجراء هذا النوع من التقسيم هو وجود الحاسبات الآلية التي تقوم بمقارنة البكتيريا المختلفة على أساس جميع الصفات المختلفة وتوضيح هذه الإختلافات في جداول سهلة ويعاب على هذا النوع من التقسيم عدم إيضاح الأهمية ( القيمة ) التقسيمية لبعض الصفات الهامة على غيرها من الصفات ذات الأهمية المحدودة.
لذلك فهذا التقسيم لا يوضح العلاقات التطورية التي يرجى الوصول إليها بالتقسيم الطبيعي .
التقسيم على أساس التشابه في الأحماض النووية :
يحتوي الحمض النووي د.ن.أ D N A على القواعد الأربع المعروفة آدنين(A ) وثيمين (T) وجوانين(G) وسياتوسين (C) وفي السلسلة المزدوجة لهذا الحمض النووي ترتبط قواعد الجوانين (G) بقواعد السيايتوسين (C) برابطة إشتراكية ثلاثية . وترتبط قواعد الثايمين (T) بقواعد الآدنين(A) برابطة إشتراكية ثنائية .وعلى ذلك تكون نسبة الجوانين = نسبة السبايتوسين في أي بكتيريا . كما تكون نسبة الأدنين = نسبة الثايمين.
وكذلك فإنه كلما زادت نسبة الجوانين والسبايتوسين تقل نسبة الأدنين والثايمين في الحمض النووي لأي بكتيريا . وبمعنى آخر كلما كانت نسبة الجوانين + السبايتوسين = 60% فإن نسبة الأدنين + الثايمين = 40% . فهذا يعني أن نسبة كل من الجوانين والسبايتوسين =30% لكل منهما ونسبة كل من الأدنين والثايمين = 20% لكل منهما .
وقد اثبتت الدراسات عند بداية معرفة التركيب الدقيق للأحماض النووية أن الأحياء المختلفة تحتوي على نسب مختلفة من هذه القواعد الأربع ولذلك ظهرت قيمة تقسيمية لتحديد نسبة كل من الجوانين + السبايتوسين ( وهي تقاس بتقدير درجة الإنصهار Melting point عادة للحمض النووي D N A .
وقد ثبت أيضاً أن الكثير من الأحياء التي تحتوي على نفس النسب من القواعد المختلفة قد يكون بينها اختلاف كثير . إذ أن وجود نفس القواعد بترتيب مختلف لاشك ينتج عنه أحياء مختلفة ولذلك فكر العلماء ( علماء التقسيم ) في دراسة مدى تطابق ترتيب القواعد في الحمض النووي D N A .
ويمكن دراسة مدى تطابق ترتيب القواعد النتروجينية في الحمض النووي D N A لأحياء مختلفة بدراسة إمكانية تكوين سلاسل مزدوجة Duplex من سلاسل مفردة مأخوذة من أحياء مختلفة .
قبل أن ندخل في تقسيم المجموعات البكتيرية يجب أن نلم بمدلول بعض المصطلحات المستعملة في الدراسة التقسيمية فمثلاً :
النوع :Species
وهو مجموعة تشمل كل البكتيريات المتشابهة في جميع صفاتها . ويترك للباحث تحديد الإختلاف التي تميز بين أي نوعين مختلفين حيث لا يوجد أي مباديء قياسية يمكن إتباعها في هذا الصدد ، والنوع هو اعتبار تقسيمي محض من الصعب تعريفه وتحديده ، هذا وقد أجمع العلماء على أن الصفات التي يمكن تقسيم النوع على أساسها يجب أن تكون صفات ثابتة وغير متغيرة.
الجنس : Qenus
هي مجموعة تشمل الأنواع التي تتميز بصفات ثابتة وغير متغيرة . بينها وبين بعضها علاقة وراثية بمعنى أن تجمع عدة أنواع تحت جنس واحد يجب أن يتم طبقاً للتشابه في الصفات الطبيعية الثابتة التي ترجع إلى تطابق التركيب الوراثي للأنواع .
وهناك عدة صعوبات لتصنيف الأنواع داخل الجنس الواحد أهمها أن معظم الأنواع ليست مدروسة دراسة وافية . بدرجة تسمح بالتفرقة بين صفاتها الثابتة الأخرى التأقلمية التي تتغير طبقاً للظروف البيئية علاوة على الصعوبة التي تتمثل في تعدد الأسماء الدارجة والمحلية للنوع البكتيري الواحد . وللتغلب على تلك الصعوبات في إدماج الأنواع في جنس واحد يتحتم على مكتشفي الأنواع الجديدة أن يبحثوا وينقبوا في المراجع البكتيريولوجية للتاكد من ان النوع الجديد المكتشف لم يوصف من قبل فإذا كان الأمر كذلك كان عليهم القيام بوصفه وصفاً دقيقاً . وقد يكون الجنس وحيد النوع بمعنى أنه يشمل نوعاً بكتيرياً واحد Monotypic أو أن يحتوي الجنس على عدة أنواع
العائلة : Family
هي مجموعة تضم الأجناس المتشابهة أو المتقاربة . وعادة يشتق اسم العائلة من اسم الجنس المثالي لها Type genus مع إضافة المقطع aceae فمثلاً Bacillaceae سميت تبعاً لجنسها المثالي Actinomy Cetaceae Bacillus سميت تبعاً لجنسها المثالي Actinomyces وهكذا .
الرتبة : Order
تضم مجموعة من العائلات المتشابهة أو المتقاربة . ويشتق اسم الرتبة من اسم العائلة المثالية Type Family مع استبدال المقطع aceae بالمقطع (ales) Speirochae + ales وActinomy Cetales وهناك بعض المجاميع الفرعية مثل تحت الرتبة Suborder أوTribe حيث تضم الأولى عدة عائلات وتبعاً لطبعة 1974 من المرجع Bergeys Manual فإن الكائنات ذات النواة البدائية بما فيها البكتيريا ضمت في مملكة قائمة بذاتها تعرف بمملكة البروكاريوتاتKing dom procaryotae وفي التصنيف الحديث للبكتيريا تصنيف ( برجي _ الطبعة التاسعة 1989 )
تم تصنيف مملكة البروكاريوتا إلى أربعة أقسام كبيرة Four Divisious
وقسمت هذه الأجزاء إلى 33 قسم Section تبعاً لصفاتها الهامة والأجزاء هي :
K . Prokaryote .
D . I Gracilicutes . أولاً :
D . II Firmicutes ثانياً :
D . III Tenericutes . ثالثاً :
D . IV Mendosicutes رابعاً :
وسنذكر هذه الأقسام بشيء من التفصيل ونذكر صفات كل قسم على حدة ونطرق إلى المجاميع التي تنتج كل قسم
أولاً : البكتيريا ذات الجدار الرقيق
D . I : Gracilicutes ( gracilis = Thin رقيق .Cutes = Skin )
وتشمل البكتيرات التي تمتلك جدار خلوي معقد يتكون من ثلاث طبقات ( طبقة خارجية وطيقة داخلية وطبقة وسطية من الببتيد وجليكان ) (والتي تحتوي على حمض الميوراميك وهذه توجد في كل البكتيريا إلا أن القليل منها فقد هذه الطبقة الوسطية ) كما يحتوي الجدار علاوة على ذلك على بعض المكونات المختلفة الأخرى خارج أو داخل هذه الطبقات .
خلايا هذه المجموعة عادة سالبة لصبغة جرام . ذات أشكال كروية ، أو بيضية أو عصويات مستقيمة أو منحنية أو حلزونية وأحياناً تكون خيطية بعض هذه الأنواع قد تكون محاطة بغلاف Capsule أو غمدSheath .
التكاثر يتم بالإنقسام الثنائي ولكن بعض المجموعات يمكن أن تتكاثر عن طريق التبرعم ونادراً ما يحدث التكاثر عن طريق الإنقسام العديد مثل pleurocapsales وهي لا تكون جراثيم داخلية .
البعض منها يكون أجسام ثمرية أو جراثيماً ازجة تعرف بالميكسوسبورات Myxospores كما في Myxobacteralesوهذه الجراثيم تتحرك عن طريق السباحة بحركة انزلاقية كما أن بعض أفرادها عديم الحركة . قد تكون ممثلة للضوء أو غير ممثلة للضوء . وتضم أنواع هوائية ولا هوائية إختبارية . بعض الأنواع متطفلات إجبارية داخل الخلايا .
ويضم هذا القسم ثلاثة صفوف : Class 1 : Scoto bacteria
Class 2 : Anoxphoto bacteria
Class 3 : Oxyphoto bacteria
ثانياً : البكتيريا ذات الجدر الصلبة
D . II: Firmicutes ( Firmus = Strong )
وتضم هذا القسم البكتيريا موجبة الجرام ( جدار آحادي الطبقة ) ، أكبر سمكاً من جدار البكتيريا السالبة الجرام ) والخلايا كروية ، عصوية أو خيطي ( متفرع وغير متفرع )وتتكاثر بالإنقسام الثنائي . بعض منها ينتج جراثيم خارجية على هيفات ، غير ذاتية التغذية تحصل على الطاقة اللازمة لها عن طريق كيميائي . وتشمل كائنات هوائية أو لا هوائية اختياراً .
ويضم هذا القسم صفين :
Class 1: Firmi ba
Class 2: Thallo bacteria
ويضم الصف الثاني بكتيريا عصوية موجبة لصبغة جرام . والاكينوميسيات ( البكتيريا الخيطية ) .
ثالثاً : البكتيريا عديمة الجدار .
D . III . Tenericutes (Tenes = Soft )
بكتيريا عديمة الجدار ( تسمى الميكوبلازمات Mycoplasmas) وتشمل صف : Mollicutes
لا تكون المادة الأولية لتخليق البيتدوجليكان . مغلفة بواسطة الغشاء البلازمي الخلايا غير منتظمة متعددة الأشكال تتدرج في الحجم من حويصلات كبيرة إلى خلايا صغيرة يصل قطرها إلى 2وميكرون . يتم التكاثر بواسطة التبرعم أو الإنقسام الثنائي أو التفتت ، وعادة هي غير متحركة ، لاتكون جراثيم سالبة الجرام ، معظم الأنواع تحتاج لنموها بيئات معقدة التركيب مثل إضافة مركبات خاصة مثل الكوليسترول، والأحماض الدهنية طويلة السلاسل .
تميل إلى اختراق سطح البيئات الصلبة مكونة مستعمرات تظهر في مجموعات بشكل البيض المقلي . نسبة جزئيات C + G في الRNA 43-48% بينما تتراوح نسبة C + G في DNA بين 23- 46% ويتميز الجينوم Genome في الميكوبلازما بأنه أقصر حجماً من ذلك في البروكاريوتا .
وهذه الكائنات حساسة للمضادات الحيوية وخاصة التتراسيكلينات . بعض الأنواع مترممة والبعض الآخر متطفلة تسبب أمراض للحيوانات والنباتات .
رابعاً : بكتيريا ذات جدار مختلف تركيبياً
D . IV : Mendosicutes (mendosus = haring faults )
وهي تشمل الكائنات بدائية النواة Gracilictes و Firmicutes ولكن يعتمد تمييزها الواضح كمجموعة وقسم مستقل على أساس ترتيب النيوكلوتيدات في جزيء RNA RNA + ، والسلاسل المتفرعة من الدهون . وتعرف بالبكتيريا الأولية Archaco bacteria معظم الكائنات وليست كلها تمتلك بعض مكونات الجدار الخلوي ولكنها لا تحتوي على حمض الميوراميك ولذلك فهي لا تحتوي على البيتدوجليكان ( الميورين ) . والبعض يمتلك جدار ذري محتوى قليل من جزئيات البروتين الكبيرة وبعض الجزئيات من عديدة السكر .
البعض سالب لجرام والبعض الاخر موجبة الجرام والشكل المورفولوجي ، خلايا كروية أو عصوية أو خيطية . وهي أو أن تكون متحركة ، أو غير متحركة . معظمها لاهوائية إجباراً ولكن بعض المجاميع منها هوائية . وتضم:
البكتيريا المنتجة للميثان Group I Methanogens
البكتيريا المحبة للملوحة اجباراً Group II Strict halophiles
البكتيريا المحبة للحموضة والحرارة Group III Thermoacidophiles
هذا وتبعاً لتصنيف بيرجي الطبعة التاسعة . ثم توزيع البكتيريا في مجاميع تضم (23 فصلاً Section ) والتي تضمنتها الأقسام الأربعة الكبيرة .
وفيما يلي سنذكر هذه الفصول والمجاميع وصفات كل مجموعة والرتب والعوائل والجناس التابعة لكل مجموعة : -
1- سبيروكيتات ( البكتيريا الحلزونية المرنة )
Group I : The Spirochetes.
وتضم رتبة واحدة Order : Spirochatales
أفراد هذه الرتبة ذات خلايا مرنة وذات مظهر حازوني يحتوي على انثناءة واحدة كاملة بعض الأفراد يظهر بروتوبلازماً متجانساً أو قد يترتب بطريقة خاصة بحيث تظهر الخلايا كأنها ملتفة بواسطة خيط محوري أو ذات حراشيف جانبية أو ذات تجاويف ضيقة أو ذات تخطيطات عرضية ز تحاط بغلاف أو جدار ويلتف حولها 2 او اكثر من اللويفات والتي تحيط بالغلاف الخارجي .
كل أفراد هذه الرتبة متحركة بالرغم من عدم امتلاكها أسواط وحركة البكتيريا تتضمن التفاف الخلية حول محورها الطولي . وتتكاثر بواسطة الإنفلات العرضي .
كيموعضوية التغذية ومنها الهوائية ولاهوائية اختبارية ولاهوائية أو ميكروإيروفيك وهي سالبة الجرام . والأنواع الصغيرة منها تكون قدرتها على كسر الضوء أقل كثيراً من البكتيريا الحقيقية لذلك فلا يمكن رؤيتها إلا بإستعمال المجهر ذو الحقل المظلم . معظم أفرادها رميات .
وتشمل هذه الرتبة عائلتين : -
1- Family : Spirochaetaceae
ويتبع هذه العائلة 4 اجناس : -
1-G : Spirochaetaceae .
2- G : Cristospira .
3- G : Borrelia .
4- G : treponema .
والنوع Species المثالي للجنس الرابع هو Treponema Pallidum
2- Family :Leptospiraceae .
G 1 : Leptosipira
2-البكتيريا الحلزونية أو الضمية السالبة لجرام الهوائية والتي تتطلب حفظ قليل من الأكسجين والمتحركة
Group 2: Aerobic / Microaerophilic , Motile , Helical / Vibrioid . Gram – negative bacteris .
عصويات صلبة منحنية حلزونية مع وجود أقل من لفة كاملة إلى عدد من اللفات . متحركة تعوم في خطوط مستقيمة مع وجود حركة مميزة تشبه ثاقب الفلين . تستوطن التربة والبيئات المائية تتحرك بواسطة اسواط قطبية ، هوائية أو ميكرو إيزوفيلية وتستخدم الكسجين كمستقبل للألكترونات معظم الأنواع لا تستغل الكربوهيدرات . كيموعضوية التغذية ( قليل من الأنواع تستغل عدد محدود أو تنمو قليل منها في وجود خليط من Co2 ، H2 أي غير عضوية التغذية ) والبعض يثبت النتروجين الجزيئي في وجود ضغط منخفض من الأكسجين . بعض الأنواع تصاحب الجذور النباتية ، والبعض يتواجد في تجويف الفم والأعضاء الجنسية للإنسان وبعض الحيوانات ومنها المتطفل . موجبة الأوكسيديز . سالبة الأندول . بعض الأنواع تستطيع إنتاج صبغة خضراء مصغرة ذائبة في الماء .
ويشمل هذا القسم ثمانية أجناس يمكن التفرقة بينها حسب الخصائص والصفات الآتية :-
1- الخلايا ملتفة حلزونية Helical أو ضمية Vibrioid
2- بكتيريا لا تصاحب الإنسان أو الحيوان طبيعياً وليس لها تأثير ضار على البكتيريا الأخرى
3- بكتيريا توجد عادة في الماء العذب Fresh Water
والأجناس التابعة لها هي :-
- جنس اكواسبيريللوم 1- G : Aqua spirillium .
- جنس سبيريللوم 2- G : Spirillum .
- جنس آزوسبيريللوم 3- G : Azo spirillum .
- جنس اوشانوسبيريللوم 4- G : Oceano spirillum .
- جنس كامبيلوباكتر 5- G : Campylo bacter
- جنس بدلوفبريوم 6- G : Bdello vibrio .
- جنس فامبيروفبريوم 7- G : Vampiro vibrio .
وتم إضافة جنس ثامن وهو - جنس سبوروسبيريللوم 8- G : Sporo sbirillum .
3- البكتيريا المنحنية والسالبة لجرام غير المتحركة ( أو نادرة الحركة )
Group 3: Nonmotile ( or Rarely motile ) . Gram – Negative Curred Bacteria
وتشمل عائلة واحدة وهي : Family : Spirosomaceae
بكتيريا منحنية ، سالبة الجرام ، تستوطن التربة والبيئات المائية ن غير متحركة ، هوائية اجباراً وتستطيع إنتاج احماض من بعض الكربوهيدرات في الظروف الهوائية .
ويتم تصنيف الأجناس التابعة لها تبعاً للصفات الهوائية .
أيض تنفسي ، موجبة الأكسيديز ، عصويات ذات انحناءة واحدة كاملة ، كما قد تتواجد الخلايا على هيئة حلزونيات
• التراكيب الحلقية سائدة . لا حويصلات غازية ، غير متحركة ، والمستعمرات صفراء إلى وردية .
والأجناس التابعة لها هي : G : Runella G : spirosoma
G : Cyclobacerium G : Flectobacillus
• التراكيب الحلقية نادرة ، لاتتكون حلزونيات . قد تتواجد حويصلات غازية للطفو في البيئات المائية ، نادرة الحركة ، المستعمرات بيضاء أو صفراء باهتة كما في :-
جنس G : Microcylus ( ويسمى حالياً Ancylo bacter )
• أيض( تخمري ) سالبة الأوكسيديز ، خلايا مستقيمة أو واوية ، تتواجد الحويصلات الغازية وهي غير متحركة ز كما في جنس : G : Meniscus .
• خلايا قوسية الشكل ذات حويصلات غازية ، متجمعة ، غير متحركة ، تتواجد في البحيرات وكذلك مستنقعات حيث تتواجد الكبريتيدات . كما جنس : G : Barchyarcus .
• خلايا منحنية رفيعة تجمع في رباعيات مسطحة أو مضاعفاتها ، متحركة ، تتواجد في رواسب المياه العذبة والملحة المحتوية على الكبريتيدات . لم يتم عزلها من مزارع فقيه وغير معروف تفاعلها مع صبغة جرام :
جنس G : pelosigma .
4- العصويات والكرويات السالبة لصبغة جرام .
Group 4 : Gram – Negative aerobic Rods and Cocci .
وتضم هذه المجموعة ثمانية عوائل Family أو فصائل وسنذكرها مع الأجناس التابعة لها وسنذكر نبذة مختصرة عن صفات كل عائلة :-
1- الفصيلة السيدوموناديه 1- Family : pseudomonad aceae .
وهي عصويات مستقيمة أو منحنية ، سالبة الجرام ، متحركة عادة بأسواط طرفية ، كيموعضوية التغذية هوائية ذات أيض تنفسي ، موجبة الكتاليز ، تنمو في المجال الحراري 54م أو أقل إلى 543م غير متجرثمة ، غير ذاتية التغذية . بعضها يسبب أمراض للإنسان والنبات . تنتشر أفراد هذه العائلة بدرجة واسعة بالطبيعة فهي توجد بالتربة أو بالمياه .
وتضم هذه العائلة أربعة أجناس :
G1: pseudomonas
G2: Xanthomonas
G3 : Zoogloea
G4 : Frateuria
ويعتبر الجنس الأول Pseudomonas هو الجنس النمطي لهذه الفصيلة Type Genus
2- العائلة أو الفصيلة الأزوتوباكتيريه . 2- Family : Azotobacteraceae
أفراد هذه العائلة تتراوح في مظهرها بين العصوية القصيرة والبيضية الكبيرة ، أنواعها تعيش حرة وتثبت النتروجين الجوي الجزيئي ، تعيش معيشة حرة بالتربة وهي هوائية إجباراً ، محركة ذات أسواط جسمية ، أو غير متحركة ، تنمو كيموعضوية التغذية ولا تحتاج إى عوامل نمو، بعض أجناسها تكون حويصلات . وتضم جنسين :
G1 : Azoto bacer .
G2 : Azomonas
3- العائلة الريزوبية 3- Family : Rhizobiaceae
الخلايا عصوية متحركة ( تتحرك بسوط واحد طرفي أو تحت طرفي أو تتحرك بأسواط جانبية(2– 6) هوائية ، سابة الجرام ، تشيد مواد هلامية على البيئات المحتوية على كربوهيدرات ، غير متجرثمة ، غير ذاتية التغذية ، قادرة على تثبيت النتروجين الجوي عندما تعيش نبادل منفعة أ ومعيشة تكافلية مع جذور البقوليات محدثة عقد في جذورها . وبعضها تصيب النباتات مسببة لها تورمات ولا تثبت النتروجين الجوي . وتضم أربعة أجناس يتم التمييز بينهما عن طريق أنواع النباتات التي تعيش معها معيشة تكافلية أو تسبب أمراض لها ، وقدرتها على تثبيت النتروجين الجوي والأجناس هي :
G1 : Rhizobium
G2 : Brdyrhizobium
G3 : Agrobacterium
G4 : phyllobacterium
4- العائلة الميثيلوكوكية 4 Family : methylococcaceae
أفراد عصوية ، كروية ، واويات ، قادرة على استغلال الميثان CH4 والميثانول Ch3 oH كمصدر وحيد للكربون والطاقة وذلك تحت الظروف الهوائية أو الميكروإيزوفيلية وتعرف بالبكتيريا المثيلية التغذية إجباراً وبعض أنواع هذه المجموعة تستطيع أيضاً استغلال المركبات الكربونية العضوية ومن ثم تعرف بالبكتيريا المثيلية التغذية اختباراً وتضم العائلة جنسين هما :
G2 : Methylomonas
G1 : Methylococcus
وعند استغلال هذه البكتيريا للميثان أو الميثانول تحتوي الخلايا توغلات غشائية داخلية معقدة ومعظم الأنواع تكون حويصلات . والأنواع المثالية للأجناس السابقة هما :
Methylococcus Capsulatus.
Methyiomonas Methanica .
5- الفصيلة الهالوبكتيرية 5 Family : Halobacteriaceae
وتضم أنواع البكتيريا المحبة للملوحة والخلايا كروية وعصوية الشكل وذات صفات تركيبية وفسيولوجية خاصة . التكاثر بالإنقسام الثنائي البسيط ، سالبة الجرام . هوائية اجباراً حيث تستعمل الO2 كمستقبل نهائي للألكترونيات . وتستعمل الميثان والفورمالوهيد كمصدر وحيد للكربون والطاقة . درجات الحرارة المثلى للنمو تتراوح بين 20-535م . النسبة المئوية للقواعد النتروجينية C + G 66-68% ، تتطلب بشدة كلوريد الصوديوم للنمو . وقد تم تصنيفها حديثاً ضمن البكتيريا الأولية . وهي إما متحركة أو غير متحركة وتضم الجنسين
G1 : Halobacterium .
G2 : Halococcus.
6- الفصيلة (العائلة) الأسيتوباكتيرية 6 Family ; Acetobacteraceae
سالبة أو متغيرة الجرام ، الخلايا صولجانية اشكل عصوية ، تتواجد منفردة أو مرتبة في أزواج أو سلاسل . متحركة بأسواط جسدية أو 1-8 أسواط طرفية ، أو غير متحركة ، هوائية ذات أيض تنفسي ، عادة موجبة الكتاليز( عدا نوعين ) سالبة الأوكسيديز . درجة الحرارة المثلى للنمو 25-530م ، وph المثلى 5-6 تؤكسد الإيثانول إلى حامض الخليك في البيئة الحامضية والمتعادلة . ولا تنتج الأندول . النسبة المئوية لل(C + G ) في الDNA 51-65% وتحتوي الفصيلة على جنسين :
G1 : Aceto bacter .
G2 : Gllucono bacter
الجنس الأول : يؤكسد اللاكتات أو حمض الخليك إلى ثاني أكسيد الكربون ، متحركة بأسواط جسدية أو غير متحركة .
الجنس الثاني : لا يؤكسد اللاكتات أو حمض الخليك إلى ثاني أكسيد الكربون ،متحركة بأسواط قطبية أو تكون غير متحركة.
7- الفصيلة الليجيونيللية 7 Family : Legionellaceae.
عصويات سالبة الجرام . لا تكون جراثيم داخلية أو حويصلات صغيرة . متحركة بسوط واحد أو أكثر من الأسواط الطرفية أو الجانبية ، تحتاج لنموها إلى السيستين وأملاح الحديد . لا تستطيع أكسدة أو تخمر الكربوهيدرات . تحلل الجيلاتين ولا تختزل النترات وسالبة الأوكسيديز واليورياز ودرجة الحرارة المثلى للنمو 25-530م الأنسب 5و5-6 ( معظمها تنمو في بيئات شديدة الحموضة pH 3.6 ) ممرضة للإنسان وبعضها يسبب التهاب رئوي للإنسان ونسبة ال(C+ G) في الDNA 39- 43% وتحوي العائلة جنس واحد :
وتستوطن أنواعه المياه السطحية وخاصة المناطق الموحلة والأنهار الملوثة
G1 : Legionlla
8- الفصيلة النيسيرية 8 Family: Leisseriaceae
الخلايا الكروية في أزواج أو في كتل أو عصويات في أزواج أو في سلاسل قصيرة ، غير مسوطة ،سالبة الجرام . بعض تكون اصباغ من Xanthephyll بعض الأنواع تحتاج إلى احتياجات غذائية معقدة بعد العزل مباشرة ولكن باستمرار وجودها في بيئة صناعية يمكن إقامتها في بيئات بسيطة معظم الأنواع تنتج الألماليز وسيتوكروم أو اكسيديز فهي هوائية .
تتطفل على الحيوانات ذات الدم الدافي فيما عدا الجنس اسيتوباكتر فهو غالباً مترمم يستوطن التربة والبيئات المائية . وتضم الأجناس التالية :
G1 : Neisseria
G2 : Moraxella
G3 : Acineto bacter
G4 : Kingella
والجنس الأول هي الأهم حيث أن بعض أنواعه تحلل كرات الدم الحمراء ، فهي تتطفل على الحيوانات والإنسان ومن أهم أنواع الجنس الأول والأنواع هي :
حيث يسبب مرض جنسي يسمى السيلان - Neisseria gonorrhoeae .
حيث يسبب مرض الإلتهاب السحائي ( الحمى الشوكية ) - Neisseria Meningiidi .
5- العصويات غير الهوائية اختياراً والسالبة الجرام
Group 5 : Gram . Negative Facultatively anaerobic Rods
أعضاء هذه المجموعة من أكبر المجاميع البكتيرية سالبة الجرام غير التمثيلية المدروسة جيداً لأهميتها الطبية وعلاقتها بكثير من الأمراض التي تصيب الإنسان والحيوان ، عصويات صغيرة مستقيمة أو منحنية لاتزيد عن 1/2 ميكروميتر في القطر ، بعضها غير متحرك ، والمتحرك منها جانبي الأسواط ، وقد تكون الأسواط قطبية أو مختلطة .
هذه المجموعة لا هوائية إختيارية ، وتحت الظروف اللاهوائية تحصل البكتيريا على الطاقة من تخمرالكربوهيدرا ت ،وتحت الظروف الهوائية تستغل المجموعة كثير من المواد العضوية في التنفس وتضم ثلاث فصائل :-
1- الفصيلة الأنتيروبكتيرية 1- Family : Entero bacteriaceae
وهي عصويات مستقيمة ، متحركة بأسواط جانبية أو غير متحركة . معلبة أو غير معلبة . كيمو عضوية التغذية والبعض تحتاج فيتامينات أو أحماض أمينية ، عادة تتحرك التترات إلى تتريت.
المستعمرات غير ملونة أو ملونة ( وردية إلى حمراء ) بغض الأجناس مترمم والبعض يسبب أمراض للإنسان والحيوانات ذوات الدم الدافيء ومنها الأسماك . واسعة الإنتشار في النباتات الطبيعية وتضم الأجناس :
G1 : Escherichia G2 : Edwardsiella G3 : Shigella G4 : Citro bacter
G5 : Salmonella G6 : Klebsiella G 7 : Hafnia G8 : Enterobacter
G9: Serratia G10 : Broteus G11: Yersinia G12 : Erwinia
G13: providencia
من الأنواع التابعة للجنس الأول :- .Escherichia Co li
= = = = الثالث: وتسبب الدوسنتاريا الباسيلية .Shigella alysenteriae - Sh . Shiga
= = = = الخامس : الحمى التيفية .S.typhosa - S . paratyphi -S .Typhimurum
= = = = الرابع : ويسبب الإلتهاب السحائي . Citrobacter dirersus
= = = = السادس : ومن أهم الأنواع . Klebsiella pneumonia
= = = = الثاني عشر : المسبب للذبول الوعائي .Erowinia stewartii
= = = = العاشر : . proteus vulgaris
2- الفصيلة الفبريونية 2 Family : Vibrionaceae
عصويات مستقيمة أو منحنية ، تتحرك بأسواط طرفية كيموعضوية التغذية ( عدد قليل يحتاج عوامل نمو ) ومعظم الأنواع تحتاج 2-35% Nad للنمو الأمثل . لا هوائية اختيارية ، لا تختزل النترات .
عادة تستوطن المياه وتكون مصاحبة للحيوانات ، وعديد من الأنواع ممرضة للإنسان والأسماك والضفادع وفقاريات ولا فقاريا أخرى وتضم الأجناس التالية :-
1. الجنس فبريو G1 : Vibrio
عصويات منحنية ، متحركة بأسواط . كيموعضوية التغذية ، قليل منها يحتاج عوامل للنمو ومعظم الأنواع تحتاج إلى Nad لنموها تضم أنواع تسبب أمراض للإنسان وهي : المسبب لمرض الكوليرا Vibrio Cholerae
2. الجنس فوتوباكتير G2 : Photobactrium
عصويات مستقيمة ، تتحرك بواسطة 1- 3 أسواط طرفية غير مغلفة بعضها غير متحركة . كيموعضوية التغذية . تستوطن البيئات البحرية والعض يتكافل مع الأسماك البحرية .
3. الجنس إيروموناس G3: Aeromonas
عصوية مستقيمة إلى كروية الشكل . تتحرك بسوط طرفي ونوع واحد غير متحرك . تختزل النترات وهي كيمو عضوية التغذية ، تستوطن المياه العذبة ومياه الصرف الصحي . بعض الأنواع ممرض للأسماك والضفادع .
4. الجنس بليزيوموناس G4 : Plesiomons
عصويات مستقيمة متحركة بأسواط طرفية ، كيموعضوية التغذية تتواجد على الأسماك والحيوانات المائية بعض السلالات تسبب إسهال للإنسان .
3-الفصيلة الباستيريللية 3 Family : Pasteurellaceae
خلايا عصوية إلى كروية الشكل وقد تتعدد الأشكال تبعاً لعمر المزرعة والعوامل البيئية ، سالبة الجرام ، غير متحركة ، هوائية ولا هوائية اختيارية . وسطية الحرارة . كيموعضوية تنمو على الأوساط الغذائية المعقدة التركيب، تختزل النترات إلىنتريت ، موجبة الكتاليز والأوكسديز ، تتطفل على الفقاريات وخاصة الثدييات ( ومنها الإنسان ) والطيور ومعظم الأنواع الممرضة تحتوي على علبة أنتيجينية . وتضم ثلاثة أجناس :
G1 : Pasteurella
G2 : Actinobacillus
G3 : Haemophilus
6- العصويات غير الهوائية والسالبة لجرام
Group 6 : Anaerobic Gram – negative Striaght
بكتيريا لاهوائية اجبارية ، سالبة الجرام . عصويات مستقيمة أو منحنية أو حلزونية ، متحركة أو غير متحركة وهي كيموعضوية تخمر الكربوهيدرات ، وتضم عدد من الأجناس يمكن التمييز بينها تبعاً للصفات المورفولوجية والفسيولوجية ( المدى الحراري للنمو – شكل الخلايا – الحركة وترتيب الأسواط – نوعية الأحماض الناتجة عن الأيض التخمري . والأجناس التابعة لها هي :-
G1 : Bacteroides G2 : Fusibacteriuim G3 : Succinimonas
G4 : Selenomonas G5 : Butyrivibrio G6 : Leptotrichia
G7 : Succinivibrio G8 : Anaerob G9 : Aceptotrichia
G10: Pectinatus G11:Anaerovibrio G12: Asporomus
G13: Lachnospira G14: Haloanaerobium G15:Halobacteroides
G16: Megamonas G17: Welinella G18: Themobacteroides
وهذه الأجناس السابق ذكرها تتجمع في عائلة وهي : Family : Bacteroidaceae
7- البكتيريا الممثلة للكبريتات والمختزلة للكبريت
Group 7: Dissimilatory Sulfate – or – s . Reducing
أفراد هذا القسم غير هوائية اجباراً وسالبة الجرام . تستخدم السلفات ومركبات كبريت أخرى مؤكسدة كمستقبل للألكترونات ، تحتوي الخلايا على سيتوكرومات من النوع C أو B أو الإثنين معاً ، ويضم القسم ثمانية أجناس : -
1. يؤكسد الستيتات إلىCo2 ويستخدم S كمستقبل للألكترونات ولاتختزل السلفات مطلقاً.
G1: Desulfuromonas.
2. يؤكسد اللاكتات إلىCo2 وبعضها تستخدم الحماض الدهنية بعد أكسدتها أكسدة كاملة .
G2: Desulfovibrio
3. يؤكسد البيروفيك أكسدة غير كاملة إلى استيات وCo2 .
G3: Desulfomonas.
4. قادر على أكسدة الحماض الدهنية أو البنزوات أكسدة كاملة .
G4: Desulfococcus.
5. يؤكسد الأستيتات أكسدة تامة إلى Co2 وينمو في مياه البحر .
G5: Desulfobacter.
6. يقوم بأكسدة غير كاملة للببتون أو الأكتات إلى أستات وCo2
G6: Desulfobulbus.
7. جميع أنواعه قادرة على تكوين جراثيم داخلية .
G7: Desulfotomaculum.
8. تؤكسد الأحماض الدهنية أو النترات أكسدة كاملة .
G8: Desulfosarcina.
9. تؤكسد الأحماض الدهنية كاملاً.
G9: Desulfonama.
- الجنس السابع يصنف تحت المجموعة الأولى –Subgroup 1
- الجنس الثاني والثالث والسادس تحت المجموعة الثانية – Subgroup 2
- الجنس الخامس والرابع والتاسع والثامن تحت المجموعة الثالثة . _Subgroup 3
- الجنس الأول تحت المجموعة الرابعة _Subgroub 4
8- البكتيريا الكروية اللاهوائية السالبة لجرام
: Group 8 : Anaerobic Gram – Negative cocci.
المجموعة خلايا كروية تترتب في ازواج ، غير متحركة سالبة الجرام اجبارية لاهوائية . سالبة الأكسيديز والكتاليز. كيموعضوية التغذية ذات احتياجات غذائية معقدة . تخمرأو لا تخمرالكربوهيدرات . فتطفل على بعض الحيوانات ومنها الإنسان . ويتبع المجموعة عائلة واحدة هي :
Family : Veillonellaceae
ويتبعها جنس واحد وجنسين آخرين أي ثلاث أجناس .
G1: Voillonella
G2 : Acidaminococcus
G3: Megasphaera
حيث يتميز الجنس الأول بتطفله على الإنسان والحيوان فهو يتواجد في الفم والقنوات المعوية والتنفسية للإنسان والحيوان .
وسمي الجنس الثاني بهذا الإسم لأنه يفضل الأحماض الأمينية كمصدر وحيد للكربون والطاقة وخاصة الجلوتاميد .
9- الركتسيات والكلاميدات
Group 9: Rickttsias and Chlamydias
ويضم هذا الجزء رتبتين :-
1- رتبة الركتسيالات Order : Richettsiales
2- رتبة الكلاميديات Order : Chlamydiales
1- رتبة الركتسيالات Richettsiales
معظم الأنواع عصوية الشكل أو كروية أو متعددة الأشكال ، عديمة الأسواط ، سالبة الجرام اجبارية التطفل على الفقاريات ( تسبب العديد من أمراض الحمى ) وتنقسم داخل خلايا العائل بواسطة الإنقسام الثنائي . يمكن تثمينها على بيئات معملية مثل بيئات آجار الدم blood agar وتكون المفصليات أحد نواقل هذه الأمراض فهي العائل الأولي وتشمل ثلاث فصائل هي تحت عائلة Rickettsiaceae
Tribe1- Rickettsieae Tribe2- Ehrlichieae Tribe 3- Wolbachieae
2- رتبة الكلاميديات Chlamydiacea
طفيليات اجبا رية لا تنموعلى البيئات الصناعية ، لاتنقلها اللافقاريات أي تكون العدوى بالإتصال المباشر تنقسم الإنقسام الثنائي . كروية الخلايا . غير متحركة . سالبة الجرام
وتضم عائلة واحدة :- Family : Chlamydiacea
وتضم جنس واحد G1 : Chlamydia
والذي يمتلك نوعين هما : C . Trachomatis الذي يسبب مرض التراكوما عند الإنسان والطيور
C . Psitiaci والذي يصيب الإنسان والطيور أيضاً .
10- الميكوبلازما
Group 10 : Mycoplasmas
Division : Tenericutes
Class : Mollicutes
Order : Mycoplasmatale
وتعتبر الميكوبلازما أصغر الكائنات الحية حجماً وتختلف عن البكتيريا الأخرى في غياب الجدار الخلوي ، فهي بذلك لا تصبغ بصبغة جرام . ذات أشكال مختلفة .وخلايا ذات قطر يتراوح بين 150-300 nm تتكاثر بتكوين جزئيات أولية صغيرة تصعب قياسها ويمكنها أن تمر خلال المرشحات البكتيرية ذات الثقوب الدقيقة ( بقطر 150 nm ) .
تحتوي هذه الرتبة على ثلاث عائلات وسنذكرها فيما يلي بإختصار والأجناس التابعة لها :
• يتطلب نمو هذه الأفراد التابعة لها و جود Sterols
1-Family : Mycoplasmataceae
وهذا الجنس سالب لأختبار اليورياز Urcase . G1: mycoplasma
= = موجب = = = . G2: Ureaplsma
• لاتتطلب لنموها وجود Sterols حيث تخلق الأحماض الدهنية
2- Family :Acholeplasmatacea
من الأسيتات وتمتلك dehydrogenases G1 : Acholeplasma Laric
• تحتاج إلى Sterols وتمتلك نظامe Phosphotrasf
3-Family : Spiroplasmataceae
من مهاجمتها للجلوكوز . تحوي جنس واحد G1: Spiroplasma
كما أن خلاياها ملتوية ( حلزونية الشكل )
11- بكتيريا تعيش داخل العائل معيشة تبادلية المنفعة
Group11 : Endosymbionts
يعتبر معيشة تبادل المنفعة شائعاً بين البروتوزوا والبكتيريا والفطريات والطحالب ويبدو أن هذه الأفراد تتأقلم على هذه الطريقة من المعيشة إذا ما توفرت البيئة المناسبة وتوجد علاقة وطيدة بين الكائنات تبادلية المنفعة وعوائلها . ولم تعرف ميكانيكية هذه العلاقة .
وعلى الرغم من أن هذه الكائنات ليست ضارة لعوائلها إلا أنه في بعض الحالات وتحت ظروف بيئية معينه يمكن أن تكون ضارة .
12- البكتيريا الكروية الموجبة الجرام
Group 12 : -Postive Cocci
تضم المجموعة اجناس تتماثل في بعض الصفات المورفولوجية ( كرويات موجبة الجرام ) والفسيولوجية ( كيموعضوية التغذية ، ميزوفيلية ، غير متجرثمة ) ويمكن التمييز بينها تبعاً لاحتياجاتهم من الأكسجين ( بعض الأجناس هوائية اجبارية ، والبعض لاهوائية اختيارية والبعض الآخر لاهوائية (إجبارية ) ونوعية تجمعاتالخلايا وأيضاً قدرتها على تشييد الكتاليز : وتضم المجموعة عائلتين وسنذكرها مع ذكر بعض الأجناس التابعة لها :
العائلة الأولى : 1 Family : Micrococcaeae
- وهي هوائية موجبة الكتاليز G1 : Micrococcus
- وهولاهوائية اختيارية وبعضها موجبة الكتاليز G2 : Staphylococcus
- والبعض الآخر سالب الكتاليز والنوع المثالي للجنس الثاني هو : Staph . aureus
- وهو المسبب لمرض التسمم الغذائي .
ويتبع هذه العائلة جنسين آخرين هما : G3: Planococcus
G4: Stamato coccus
العائلة الثانية : 2 Family : Deinococcaceae
كرويات مرتبة في أزواج أو سلاسل طويلة أوقصيرة G1: Streptococcus
بعضها تكون علبة أو كبسولة . وتخمر السكريات وينقسم الجنس أو يضم أنواع ممرضة منها (المسبب للإلتهاب الرئوي )
والذي تم تقسيمه إلى ثلاثة انماط على أساس تحليل للدم
St . pneumoniae تحليل كامل للدم .
B . haemolytic تحليل غير كامل للدم .
B.oc. haemolytic لا يحدث تحلل للدم .
خلاياه كروية الشكل يمكن للجنس هذا أن يخمر الجلوكوز مع تكوين كمية من الأحماض وكحول الإيثايل وتتواجد طبيعياً في اللبن والعصارات النباتية . G2 : leuconostoc
(النوع المثالي ) L . mesenteroides
13- العصويات والكرويات الموجبة لجرام والمتجرثمة .
Group13: Endospore –forming Gram – Postive Rods and cocci .
وتضم البكتيريا المكونة للجراثيم الداخلية ( عادة جرثومة واحدة داخل الخلية ) وهي تمثل طور من أطوار الحياة ونادراً ما يكون أن تمثل وسيلة تكاثرية . وهي كرويات وأخرى عصويات هوائية لاهوائية اختيارية . متحركة والبعض للإنسان والحيوان وتضم عدة أجناس :-
G1 : Bacillus
وهو المسبب لمرض الجمرة الخبيثة B . anthracis
B .Thuringiensis . B. Larvae . B . Lentimorbus B . popiliae
أما الأجناس الأربعة الأخيرة فلها دور في المقاومة البيولوجية للحشرات . ولها نفس الصفات السابقة للمجموعة ولكن تحتاج إلى حفظ قليل من الأوكسجين ولا تحوي الكتاليز . ومن أنواعها :
G2: Sporolactobacillus
S . inuliaus
- وهي تعتبر لاهوائية اجباراً ومنها أنواع ممرضة للإنسان G3: Clostridium
- والمسبب لمرض التيتانوس ( الكزاز ) Clostridium tetani
- والمسبب للتسمم الغذائي والذي قد يؤدي إلى الوفاة Clostridium botulinum
- وجد في التربة والقناة الهضمية للإنسان والحيوان butyricum Clostridium
G4: Desulfotomaculum .
G5: Sporosarcina.
G6: Oscillospira
G7: Amphibacillus.
G8: Sporolactobacillus .
G9:Syntrophispore
G10: Sporohalobacter
G11: Sulfobacillus
14- البكتيريا العصوية غير متجرثمة والموجبة لجرام
Group 14: Nonsporing Gtve Rods.
مجموعة من البكتيريا : تتماثل في بعض صفاتها المورفولوجية والفسيولوجية ، الخلايا عصوية ( احياناً كروية إلى عصوية طويلة إلى خيطية ) موجبة الجرام ، لاتكون جراثيم داخلية ، غير ملونة ( البعض يشيد أصباغ تنتشر في البيئة ) وسيطة الحرارة ، كيمو عضوية التغذية عادة غير متحركة والبعض متحرك عن طريق أسواط جسمية ، سالبة الكتاليز . وهي تضم سبعة اجناس :-
1-الحمض الثنائي الأمين في اليثيدوجليكان هو G1: Lactobacillus . Ornitlue , DAP ,Lysine
ويتواجد على اسطح النباتات ومنتجات الألبان ، تجمر السكريات وتقوم بتخمر لاكتيلي 0 حمض اللاكتيك فقط) وتعرف الأنواع بأحادية التخمر أو تخمر لاكتيكي مختلط ( حمض لاكتيك + خليك + كحول + Co2 ) والأنواع هي :
آحادية التخمر homo fermenters ثنائية أو مختلطة التخمر hetero fermenters
L . Casei L . acidophilus L . breuis L . buchneri
L . plantarum L .bulgraricus L . fermenti L . Thermophilus
2- الحمض الأميني في البيثيدوجليكان هو M.DAP البعض ممرض للماشية G2: Listeria
مثل النوع المثالي : L . monocytogenes.
3-الحمض الأميني في اليثيدوجليكان هوLysine G3: Caryophanon .
وعادة يوجد على براز البقر وهو غير ممرض والنوع المثالي C . Lactum
4- الحمض الأميني الثنائي في اليثيدوجليكان هو Lysine G4; Erysipelothrix .
وهو ممرض للفقاريات ومنها المسبب لمرض في الخنازير وهو النوع E . rhusiopathiae.
5-الحمض الأميني الثنائي في اليثيدوجليكان هوLysine والأول غير مرض G5: Kurthia.
6- = = = = = = = ممرض لسمك السلمون G6:Renibacterium .
7- الحمض الثنائي الأمين في اليثيدوجليكان M .DAP يتواجد على منتجات G7:Brochothrix .
اللحوم وهو غير ممرض .
15- العصويات الموجبة الجرام غير متجرثمة وغير منتظمة .
Group15: Irregular
بالرغم من أن تسمية وتصنيف البكتيريا تعتبر أحد الفروع الهامة في البكتيريولوجي Bacteriology إلا أنها لا تجذب الكثير من المشتغلين بهذا العلم .
وعلم التقسيم عموماً هو ذلك العلم أو الفرع من علوم الحياة الذي يختص بإطلاق الأسماء على الحيوانات أو النباتات أو غيرها من الكائنات الحية وتنظيمها في مجاميع تبعاً للعلاقة الطبيعية المتواجدة بينها وفي الدراسات البيولوجية لا يمكن الفصل بين التسمية Nomenclature والتصنيف Classification حيث يعتمد كل منهما على الآخر . فمثلاً لو أطلق اسم غير مناسب على كائن بكتيري فإنه يصعب تصنيفه ووضعه في مكانه الطبيعي بين البكتريا الأخرى والعكس يكون صحيحاً .
وأحد أهداف التقسيم هو اكتشاف العلاقة بين الكائنات الحية ويجب أن نفرق بين علم التقسيم Taxonomy وعلم التعرف Identification على الأحياء .
فعلم التقسيم هو محاولة ترتيب الأحياء وفقاً لاختلافها .
وعلم التعرف على الأحياء هو عبارة
عن التعرف على الأحياء تحت الدراسة ومدى مشابهتها للكائنات في أي قسم من الأقسام التي تم وضعها في علم التقسيم . ويجب ألا نخلط بين هذين التعريفين بالتسمية فهي وضع اسم لكائن حي .
ومن ذلك نرى أن التقسيم Taxonomy يشمل عمليتين هي :-
الأولى :- التسمية Nomenclature
الثانية :- التصنيف Classification أو التبويب .
عرف علم التقسيم Taxonomy ؟
عرف علم التعريف Identification ؟
عرف التسمية Nomenclature ؟
أولاً :- تسمية البكتيريا :
أن التاريخ القديم يبين محاولة العلماء لتسمية الكائنات الحية فقد قام ارسطو 384-322 قبل الميلاد بجمع نباتات عديدة مختلفة محاولاً تسميتها وتقسيمها وتبعه بعد ذلك عدة محاولات إلى أن جاء العالم السويدي Carl Ven Linne 1753 بوضع نظام التسمية المزدوج Binomial System لتسمية النباتات . ثم اقتبس هذا النظام فيما بعد لتسمية الحيوانات والكائنات الدقيقة . ولازال مستعملاً إلى الآن .
ولما كانت البكتيريا تمتلك صفات كل من النباتات والحيوانات الأمر الذي أدى إلى ارتباك العلماء في اتباع الكود النباتي ( القوانين واللوائح الخاصة بتسمية وتقسيم النباتات ) أو اتباع الكود الحيواني لتسمية البكتريا وتقسيمها . وفي عام 1903 اصطلح على استخدام الكود النباتي لتسمية وتقسيم البكتيريا . وفي عام 1947 انشيء أول كود بكتيريولوجي International bacteriology Code اثناء انعقاد الجمعية الميكروبيولوجية الدولية في كوبنهاجن بالدنمارك .
يعتبر نظام التسمية المزدوج Binomial System الذي وضعه لعالم السويدي Carl Ven Linne 1753م اول نظام تقسيمي تم تطبيقه في تسمية النباتات ثم اقتبس هذا النظام فيما بعد لتسمية الحيوانات والكائنات الدقيقة
إتفق علماء التقسيم باستخدام النظم المتبعة لتسمية النباتات في تسمية البكتيريا وذلك لوجود بعض الصفات المتشابهة بين النباتات والبكتيريا.
الأسماء العلمية Scientific names
لكل كائن حي نوعان من الأسماء ، أسماء دارجة Common أو Vernical أو Trival وهذه الأسماء الدارجة تختلف من مكان إلى آخر فمثلاً البكتيريا التي تسبب مرض التيفود يشار إليها باللغة الإنجليزية Typhoid bacillus وبالألمانية Typhus bazilen وبالفرنسية Bacille typhique وتستعمل هذه الأسماء الدارجة وهي ذات طابع محلي عادة لغرض التبيسط بدلاً من استعمال الأسماء العلمية المعقدة والطويلة .
والنوع الآخر من التسمية هو التسمية العلمية Scientific names أو Collequial names وهي الأسماء ذات الطابع الدولي يستعملها العلماء . جميعاً مهما اختلفت لغاتهم ، وتكوين هذا الإسم من الأسماء يراعى فيه نظام معين متفق عليه دولياً طبقاً للمباديء والقوانين التي جاءت في الكود البكتيريولوجي المقترح عام 1947م ويشمل هذا الكود مجموعة من اللوائح والتوصيات والتي تشبه كثيراً تلك الخاصة بالكود النباتي إلا أنها تختلف في بعض التفاصيل .
أذكر مثال للأسماء الدارجة للبكتيريا؟
الكود البكتيريولوجي المقترح عام 1947م يشمل مجموعة من اللوائح والتوصيات والتي تشبه كثيراً تلك الخاصة بالكود النباتي إلا أنها تختلف في بعض التفاصيل
ومن الأساسيات العامة في تسمية البكتيريا علمياً ما يلي :ـ
1- البكتيريا المتشابهة والمتطابقة تماماً تكون ما يسمى بالنوع Species .
2- تبعاً لنظام التسمية المزدوجة binomial فإن كل نوع بكتيري يطلق عليها اسم مكون من كلمتين كل منهما يجب أن تكون لاتينية أو يونانية الأصل وإن لم تكن كذلك يجب أن تعامل معاملة لاتينية أو يونانية.
يكتب عادة أول حرف من الكلمة الأولى وهي تشير إلى اسم الجنس Genus وقد يكون اسم الجنس المستعمل مذكراً أو مؤنثاً أو محايداً . فمثلاً الإسم Lactobacillus لاتيني الأصل ( مذكرًا ) الإسم Sarcina لاتيني الأصل مؤنثاً وMicrococcus يوناني الأصل مذكراً Corynebacterium يوناني الأصل محايداً Clostridium يوناني الأصل محايداً . وهكذا
وبعض الأسماء لأجناس معينة قد تكون أسماء لبعض الأشخاص تخليداً لذكراهم وفي هذه الحالة يجب أن يعامل الأسم معاملة لاتينية مثل Pasteurella تخليداً ( لذكرى باستير ) وNeisseria تخليداً ( لذكرى A.neisser )
والكلمة الثانية في الإسم العلمي تشير إلى النوع البكتيري وتعرف بSpecies وهذه لايكون حرفها الأول كبير إلا أنها عادة تكون :-
1- صفة تتأثر بالإسم السابق لها بمعنى أنها تتبعه في الدرجة كماSarcina alba
2- صفة في صورة فعل مضارع مثل Clostridium dissolves
3- أو تكون الكلمة الثانية المكونة للإسم العلمي عبارة عن اسم يعطي معنى التملك مثل Streptococcus/actis
4- أن يكون اسماً للتوضيح بمعنى يوضح طبيعة الإسم السابق لهActinomyces Scabies
ويمكن إضافة كلمة ثالثة إلى الأسم العلمي الثنائي ليشير إلى مؤلف الأسم الثنائي وليس إلى مكتشف الميكروب كما قد يعتقد البعض مثل : Bacillus Subtilis Cohn و Bacillus Coagulans Hammer
وأحياناً تشاهد أكثر من كلمة واحدة عقب الأسم العلمي الثنائي تكون الأولى منها بين قوسين مثل : Staphylococcus aureus (Rosenbach) Winslow & Rogers . وهذا يعني أن Rosenbach هو أول من سمى هذا الميكروب وأعطاه الأسم النوعي Species ولكن كان وضعه تحت جنس آخر الا أن Winslow & Rogers هما اللذان وضعا هذا النوع تحت الجنس Staphylococcus
أحياناً يقسم النوع إلى أصناف أو سلالات Varieties or Strains وهذا يحدث عندما تتواجد اختلافات بسيطة بين أفراد النوع لا تكفي لوضعها في نوع مستقل . فمثلا ًسلالة البكتيريا Streptococcus Lactis والتي تعطي اللبن طعم الشعيرتعرف بالإسم :- Strept . Lactis Var . maltige
من الأساسيات العامة في تسمية البكتيريا علمياً تكون البكتيريا المتشابهة والمتطابقة تماماً تكون ما يسمى بالنوع Species .
تقسيم البكتيريا Classification of Bacteria
يعتمد تقسيم البكتيريا على العلاقة بينهما أو بمعنى آخر كثرة أو قلة التشابه بينهما وتوجد أساليب مختلفة لتحديد درجة التشابه بين البكتيريا المختلفة من الصفات الظاهرية ( المورفولوجيه) والفسيولوجية والمزرعية والمصلية والمرضية والبيئية وغيرها .
ولا يوجد إتفاق تام على الأهمية النسبية لكل نوع من الصفات في تقسيم البكتيريا . وكثيراً ما تعطي صفة معينة أهمية على غيرها من الصفات للحصول على تقسيم طبيعي Natural Classification أو تقسيم تطوري Phylogenetic Classification للبكتيريا يوضح علاقة البكتيريا ببعضها على أساس منشأها المحتمل وتطورها . إذ يجمع البكتيريا ذات المنشأ المشترك مع بعضها البعض أكثر من تلك التي تختلف في المنشأ . ويمكن الوصول لمثل ذلك التقسيم لو توفرت معلومات كافية عن سائر البكتيريا والحلقات المفقودة بينهما ولكن ذلك غير متوفر حاليأ .ولذلك فبناء مثل ذلك التقسيم من الصعوبة بمكان في الوقت الحالي .
التقسيم الطبيعي للبكتيريا :-
يعتمد تقسيم البكتيريا على العلاقة بينهما أو بمعنى آخر كثرة أو قلة التشابه بينهما وتوجد أساليب مختلفة لتحديد درجة التشابه بين البكتيريا المختلفة من الصفات الظاهرية والصفات الأخرى والتي أشير إليها سابقاً .
التقسيم الاصطناعي للبكتيريا :-Artificial System
ولذلك يستخدم نوع آخر من التقسيم يسمى التقسيم الاصطناعي أو التقسيم الشكلي وهو يعتمد على صفات يسهل ملاحظتها .
وهذا التقسيم ذو فائدة عملية لتعريف البكتيريا غير المعروفة بالإضافة إلى أنه يبين العلاقات بين هذه الأحياء الدقيقة . وتعتمد طبيعة هذه العلاقات على المعاييرالمستعملة لتكوين هيكل التقسيم . وبحكم الحاجة نشأ تقسيم البكتيريا على هذا الأساس . فمثلاً يمكن الاستنتاج أن البكتيريا الكروية قريبة من بعضها البعض وأنها نشأت ووضعت مع بعضها البعض منفصلة عن البكتيريا العصوية أو الحلزونية أو الخيطية .
التقسيم العددي للبكتيريا Numerical Taxonomy
نظراً لعدم إمكانية بناء تقسيم طبيعي للبكتيريا لقلة المعلومات المتوفرة عنها وعن الحلقات المفقودة فيما بينها ، ونظراً لعدم كفاية التقسيم الاصطناعي أو الشكلي للبكتيريا لوضع هيكل تقسيمي ثابت ودائم ، فالقيمة التقسيمية للصفات المختلفة في التقسيم الاصطناعي تتغير من وقت لآخر حسب الاكتشافات المستمرة .
لذلك نشأ نوع آخر من التقسيم يسمى التقسيم العددي Numerical Taxonomy وهو يأخذ في الحسبان كل الإختلافات بنفس القيمة التقسيمية . ومما سهل إجراء هذا النوع من التقسيم هو وجود الحاسبات الآلية التي تقوم بمقارنة البكتيريا المختلفة على أساس جميع الصفات المختلفة وتوضيح هذه الإختلافات في جداول سهلة ويعاب على هذا النوع من التقسيم عدم إيضاح الأهمية ( القيمة ) التقسيمية لبعض الصفات الهامة على غيرها من الصفات ذات الأهمية المحدودة.
لذلك فهذا التقسيم لا يوضح العلاقات التطورية التي يرجى الوصول إليها بالتقسيم الطبيعي .
التقسيم على أساس التشابه في الأحماض النووية :
يحتوي الحمض النووي د.ن.أ D N A على القواعد الأربع المعروفة آدنين(A ) وثيمين (T) وجوانين(G) وسياتوسين (C) وفي السلسلة المزدوجة لهذا الحمض النووي ترتبط قواعد الجوانين (G) بقواعد السيايتوسين (C) برابطة إشتراكية ثلاثية . وترتبط قواعد الثايمين (T) بقواعد الآدنين(A) برابطة إشتراكية ثنائية .وعلى ذلك تكون نسبة الجوانين = نسبة السبايتوسين في أي بكتيريا . كما تكون نسبة الأدنين = نسبة الثايمين.
وكذلك فإنه كلما زادت نسبة الجوانين والسبايتوسين تقل نسبة الأدنين والثايمين في الحمض النووي لأي بكتيريا . وبمعنى آخر كلما كانت نسبة الجوانين + السبايتوسين = 60% فإن نسبة الأدنين + الثايمين = 40% . فهذا يعني أن نسبة كل من الجوانين والسبايتوسين =30% لكل منهما ونسبة كل من الأدنين والثايمين = 20% لكل منهما .
وقد اثبتت الدراسات عند بداية معرفة التركيب الدقيق للأحماض النووية أن الأحياء المختلفة تحتوي على نسب مختلفة من هذه القواعد الأربع ولذلك ظهرت قيمة تقسيمية لتحديد نسبة كل من الجوانين + السبايتوسين ( وهي تقاس بتقدير درجة الإنصهار Melting point عادة للحمض النووي D N A .
وقد ثبت أيضاً أن الكثير من الأحياء التي تحتوي على نفس النسب من القواعد المختلفة قد يكون بينها اختلاف كثير . إذ أن وجود نفس القواعد بترتيب مختلف لاشك ينتج عنه أحياء مختلفة ولذلك فكر العلماء ( علماء التقسيم ) في دراسة مدى تطابق ترتيب القواعد في الحمض النووي D N A .
ويمكن دراسة مدى تطابق ترتيب القواعد النتروجينية في الحمض النووي D N A لأحياء مختلفة بدراسة إمكانية تكوين سلاسل مزدوجة Duplex من سلاسل مفردة مأخوذة من أحياء مختلفة .
قبل أن ندخل في تقسيم المجموعات البكتيرية يجب أن نلم بمدلول بعض المصطلحات المستعملة في الدراسة التقسيمية فمثلاً :
النوع :Species
وهو مجموعة تشمل كل البكتيريات المتشابهة في جميع صفاتها . ويترك للباحث تحديد الإختلاف التي تميز بين أي نوعين مختلفين حيث لا يوجد أي مباديء قياسية يمكن إتباعها في هذا الصدد ، والنوع هو اعتبار تقسيمي محض من الصعب تعريفه وتحديده ، هذا وقد أجمع العلماء على أن الصفات التي يمكن تقسيم النوع على أساسها يجب أن تكون صفات ثابتة وغير متغيرة.
الجنس : Qenus
هي مجموعة تشمل الأنواع التي تتميز بصفات ثابتة وغير متغيرة . بينها وبين بعضها علاقة وراثية بمعنى أن تجمع عدة أنواع تحت جنس واحد يجب أن يتم طبقاً للتشابه في الصفات الطبيعية الثابتة التي ترجع إلى تطابق التركيب الوراثي للأنواع .
وهناك عدة صعوبات لتصنيف الأنواع داخل الجنس الواحد أهمها أن معظم الأنواع ليست مدروسة دراسة وافية . بدرجة تسمح بالتفرقة بين صفاتها الثابتة الأخرى التأقلمية التي تتغير طبقاً للظروف البيئية علاوة على الصعوبة التي تتمثل في تعدد الأسماء الدارجة والمحلية للنوع البكتيري الواحد . وللتغلب على تلك الصعوبات في إدماج الأنواع في جنس واحد يتحتم على مكتشفي الأنواع الجديدة أن يبحثوا وينقبوا في المراجع البكتيريولوجية للتاكد من ان النوع الجديد المكتشف لم يوصف من قبل فإذا كان الأمر كذلك كان عليهم القيام بوصفه وصفاً دقيقاً . وقد يكون الجنس وحيد النوع بمعنى أنه يشمل نوعاً بكتيرياً واحد Monotypic أو أن يحتوي الجنس على عدة أنواع
العائلة : Family
هي مجموعة تضم الأجناس المتشابهة أو المتقاربة . وعادة يشتق اسم العائلة من اسم الجنس المثالي لها Type genus مع إضافة المقطع aceae فمثلاً Bacillaceae سميت تبعاً لجنسها المثالي Actinomy Cetaceae Bacillus سميت تبعاً لجنسها المثالي Actinomyces وهكذا .
الرتبة : Order
تضم مجموعة من العائلات المتشابهة أو المتقاربة . ويشتق اسم الرتبة من اسم العائلة المثالية Type Family مع استبدال المقطع aceae بالمقطع (ales) Speirochae + ales وActinomy Cetales وهناك بعض المجاميع الفرعية مثل تحت الرتبة Suborder أوTribe حيث تضم الأولى عدة عائلات وتبعاً لطبعة 1974 من المرجع Bergeys Manual فإن الكائنات ذات النواة البدائية بما فيها البكتيريا ضمت في مملكة قائمة بذاتها تعرف بمملكة البروكاريوتاتKing dom procaryotae وفي التصنيف الحديث للبكتيريا تصنيف ( برجي _ الطبعة التاسعة 1989 )
تم تصنيف مملكة البروكاريوتا إلى أربعة أقسام كبيرة Four Divisious
وقسمت هذه الأجزاء إلى 33 قسم Section تبعاً لصفاتها الهامة والأجزاء هي :
K . Prokaryote .
D . I Gracilicutes . أولاً :
D . II Firmicutes ثانياً :
D . III Tenericutes . ثالثاً :
D . IV Mendosicutes رابعاً :
وسنذكر هذه الأقسام بشيء من التفصيل ونذكر صفات كل قسم على حدة ونطرق إلى المجاميع التي تنتج كل قسم
أولاً : البكتيريا ذات الجدار الرقيق
D . I : Gracilicutes ( gracilis = Thin رقيق .Cutes = Skin )
وتشمل البكتيرات التي تمتلك جدار خلوي معقد يتكون من ثلاث طبقات ( طبقة خارجية وطيقة داخلية وطبقة وسطية من الببتيد وجليكان ) (والتي تحتوي على حمض الميوراميك وهذه توجد في كل البكتيريا إلا أن القليل منها فقد هذه الطبقة الوسطية ) كما يحتوي الجدار علاوة على ذلك على بعض المكونات المختلفة الأخرى خارج أو داخل هذه الطبقات .
خلايا هذه المجموعة عادة سالبة لصبغة جرام . ذات أشكال كروية ، أو بيضية أو عصويات مستقيمة أو منحنية أو حلزونية وأحياناً تكون خيطية بعض هذه الأنواع قد تكون محاطة بغلاف Capsule أو غمدSheath .
التكاثر يتم بالإنقسام الثنائي ولكن بعض المجموعات يمكن أن تتكاثر عن طريق التبرعم ونادراً ما يحدث التكاثر عن طريق الإنقسام العديد مثل pleurocapsales وهي لا تكون جراثيم داخلية .
البعض منها يكون أجسام ثمرية أو جراثيماً ازجة تعرف بالميكسوسبورات Myxospores كما في Myxobacteralesوهذه الجراثيم تتحرك عن طريق السباحة بحركة انزلاقية كما أن بعض أفرادها عديم الحركة . قد تكون ممثلة للضوء أو غير ممثلة للضوء . وتضم أنواع هوائية ولا هوائية إختبارية . بعض الأنواع متطفلات إجبارية داخل الخلايا .
ويضم هذا القسم ثلاثة صفوف : Class 1 : Scoto bacteria
Class 2 : Anoxphoto bacteria
Class 3 : Oxyphoto bacteria
ثانياً : البكتيريا ذات الجدر الصلبة
D . II: Firmicutes ( Firmus = Strong )
وتضم هذا القسم البكتيريا موجبة الجرام ( جدار آحادي الطبقة ) ، أكبر سمكاً من جدار البكتيريا السالبة الجرام ) والخلايا كروية ، عصوية أو خيطي ( متفرع وغير متفرع )وتتكاثر بالإنقسام الثنائي . بعض منها ينتج جراثيم خارجية على هيفات ، غير ذاتية التغذية تحصل على الطاقة اللازمة لها عن طريق كيميائي . وتشمل كائنات هوائية أو لا هوائية اختياراً .
ويضم هذا القسم صفين :
Class 1: Firmi ba
Class 2: Thallo bacteria
ويضم الصف الثاني بكتيريا عصوية موجبة لصبغة جرام . والاكينوميسيات ( البكتيريا الخيطية ) .
ثالثاً : البكتيريا عديمة الجدار .
D . III . Tenericutes (Tenes = Soft )
بكتيريا عديمة الجدار ( تسمى الميكوبلازمات Mycoplasmas) وتشمل صف : Mollicutes
لا تكون المادة الأولية لتخليق البيتدوجليكان . مغلفة بواسطة الغشاء البلازمي الخلايا غير منتظمة متعددة الأشكال تتدرج في الحجم من حويصلات كبيرة إلى خلايا صغيرة يصل قطرها إلى 2وميكرون . يتم التكاثر بواسطة التبرعم أو الإنقسام الثنائي أو التفتت ، وعادة هي غير متحركة ، لاتكون جراثيم سالبة الجرام ، معظم الأنواع تحتاج لنموها بيئات معقدة التركيب مثل إضافة مركبات خاصة مثل الكوليسترول، والأحماض الدهنية طويلة السلاسل .
تميل إلى اختراق سطح البيئات الصلبة مكونة مستعمرات تظهر في مجموعات بشكل البيض المقلي . نسبة جزئيات C + G في الRNA 43-48% بينما تتراوح نسبة C + G في DNA بين 23- 46% ويتميز الجينوم Genome في الميكوبلازما بأنه أقصر حجماً من ذلك في البروكاريوتا .
وهذه الكائنات حساسة للمضادات الحيوية وخاصة التتراسيكلينات . بعض الأنواع مترممة والبعض الآخر متطفلة تسبب أمراض للحيوانات والنباتات .
رابعاً : بكتيريا ذات جدار مختلف تركيبياً
D . IV : Mendosicutes (mendosus = haring faults )
وهي تشمل الكائنات بدائية النواة Gracilictes و Firmicutes ولكن يعتمد تمييزها الواضح كمجموعة وقسم مستقل على أساس ترتيب النيوكلوتيدات في جزيء RNA RNA + ، والسلاسل المتفرعة من الدهون . وتعرف بالبكتيريا الأولية Archaco bacteria معظم الكائنات وليست كلها تمتلك بعض مكونات الجدار الخلوي ولكنها لا تحتوي على حمض الميوراميك ولذلك فهي لا تحتوي على البيتدوجليكان ( الميورين ) . والبعض يمتلك جدار ذري محتوى قليل من جزئيات البروتين الكبيرة وبعض الجزئيات من عديدة السكر .
البعض سالب لجرام والبعض الاخر موجبة الجرام والشكل المورفولوجي ، خلايا كروية أو عصوية أو خيطية . وهي أو أن تكون متحركة ، أو غير متحركة . معظمها لاهوائية إجباراً ولكن بعض المجاميع منها هوائية . وتضم:
البكتيريا المنتجة للميثان Group I Methanogens
البكتيريا المحبة للملوحة اجباراً Group II Strict halophiles
البكتيريا المحبة للحموضة والحرارة Group III Thermoacidophiles
هذا وتبعاً لتصنيف بيرجي الطبعة التاسعة . ثم توزيع البكتيريا في مجاميع تضم (23 فصلاً Section ) والتي تضمنتها الأقسام الأربعة الكبيرة .
وفيما يلي سنذكر هذه الفصول والمجاميع وصفات كل مجموعة والرتب والعوائل والجناس التابعة لكل مجموعة : -
1- سبيروكيتات ( البكتيريا الحلزونية المرنة )
Group I : The Spirochetes.
وتضم رتبة واحدة Order : Spirochatales
أفراد هذه الرتبة ذات خلايا مرنة وذات مظهر حازوني يحتوي على انثناءة واحدة كاملة بعض الأفراد يظهر بروتوبلازماً متجانساً أو قد يترتب بطريقة خاصة بحيث تظهر الخلايا كأنها ملتفة بواسطة خيط محوري أو ذات حراشيف جانبية أو ذات تجاويف ضيقة أو ذات تخطيطات عرضية ز تحاط بغلاف أو جدار ويلتف حولها 2 او اكثر من اللويفات والتي تحيط بالغلاف الخارجي .
كل أفراد هذه الرتبة متحركة بالرغم من عدم امتلاكها أسواط وحركة البكتيريا تتضمن التفاف الخلية حول محورها الطولي . وتتكاثر بواسطة الإنفلات العرضي .
كيموعضوية التغذية ومنها الهوائية ولاهوائية اختبارية ولاهوائية أو ميكروإيروفيك وهي سالبة الجرام . والأنواع الصغيرة منها تكون قدرتها على كسر الضوء أقل كثيراً من البكتيريا الحقيقية لذلك فلا يمكن رؤيتها إلا بإستعمال المجهر ذو الحقل المظلم . معظم أفرادها رميات .
وتشمل هذه الرتبة عائلتين : -
1- Family : Spirochaetaceae
ويتبع هذه العائلة 4 اجناس : -
1-G : Spirochaetaceae .
2- G : Cristospira .
3- G : Borrelia .
4- G : treponema .
والنوع Species المثالي للجنس الرابع هو Treponema Pallidum
2- Family :Leptospiraceae .
G 1 : Leptosipira
2-البكتيريا الحلزونية أو الضمية السالبة لجرام الهوائية والتي تتطلب حفظ قليل من الأكسجين والمتحركة
Group 2: Aerobic / Microaerophilic , Motile , Helical / Vibrioid . Gram – negative bacteris .
عصويات صلبة منحنية حلزونية مع وجود أقل من لفة كاملة إلى عدد من اللفات . متحركة تعوم في خطوط مستقيمة مع وجود حركة مميزة تشبه ثاقب الفلين . تستوطن التربة والبيئات المائية تتحرك بواسطة اسواط قطبية ، هوائية أو ميكرو إيزوفيلية وتستخدم الكسجين كمستقبل للألكترونات معظم الأنواع لا تستغل الكربوهيدرات . كيموعضوية التغذية ( قليل من الأنواع تستغل عدد محدود أو تنمو قليل منها في وجود خليط من Co2 ، H2 أي غير عضوية التغذية ) والبعض يثبت النتروجين الجزيئي في وجود ضغط منخفض من الأكسجين . بعض الأنواع تصاحب الجذور النباتية ، والبعض يتواجد في تجويف الفم والأعضاء الجنسية للإنسان وبعض الحيوانات ومنها المتطفل . موجبة الأوكسيديز . سالبة الأندول . بعض الأنواع تستطيع إنتاج صبغة خضراء مصغرة ذائبة في الماء .
ويشمل هذا القسم ثمانية أجناس يمكن التفرقة بينها حسب الخصائص والصفات الآتية :-
1- الخلايا ملتفة حلزونية Helical أو ضمية Vibrioid
2- بكتيريا لا تصاحب الإنسان أو الحيوان طبيعياً وليس لها تأثير ضار على البكتيريا الأخرى
3- بكتيريا توجد عادة في الماء العذب Fresh Water
والأجناس التابعة لها هي :-
- جنس اكواسبيريللوم 1- G : Aqua spirillium .
- جنس سبيريللوم 2- G : Spirillum .
- جنس آزوسبيريللوم 3- G : Azo spirillum .
- جنس اوشانوسبيريللوم 4- G : Oceano spirillum .
- جنس كامبيلوباكتر 5- G : Campylo bacter
- جنس بدلوفبريوم 6- G : Bdello vibrio .
- جنس فامبيروفبريوم 7- G : Vampiro vibrio .
وتم إضافة جنس ثامن وهو - جنس سبوروسبيريللوم 8- G : Sporo sbirillum .
3- البكتيريا المنحنية والسالبة لجرام غير المتحركة ( أو نادرة الحركة )
Group 3: Nonmotile ( or Rarely motile ) . Gram – Negative Curred Bacteria
وتشمل عائلة واحدة وهي : Family : Spirosomaceae
بكتيريا منحنية ، سالبة الجرام ، تستوطن التربة والبيئات المائية ن غير متحركة ، هوائية اجباراً وتستطيع إنتاج احماض من بعض الكربوهيدرات في الظروف الهوائية .
ويتم تصنيف الأجناس التابعة لها تبعاً للصفات الهوائية .
أيض تنفسي ، موجبة الأكسيديز ، عصويات ذات انحناءة واحدة كاملة ، كما قد تتواجد الخلايا على هيئة حلزونيات
• التراكيب الحلقية سائدة . لا حويصلات غازية ، غير متحركة ، والمستعمرات صفراء إلى وردية .
والأجناس التابعة لها هي : G : Runella G : spirosoma
G : Cyclobacerium G : Flectobacillus
• التراكيب الحلقية نادرة ، لاتتكون حلزونيات . قد تتواجد حويصلات غازية للطفو في البيئات المائية ، نادرة الحركة ، المستعمرات بيضاء أو صفراء باهتة كما في :-
جنس G : Microcylus ( ويسمى حالياً Ancylo bacter )
• أيض( تخمري ) سالبة الأوكسيديز ، خلايا مستقيمة أو واوية ، تتواجد الحويصلات الغازية وهي غير متحركة ز كما في جنس : G : Meniscus .
• خلايا قوسية الشكل ذات حويصلات غازية ، متجمعة ، غير متحركة ، تتواجد في البحيرات وكذلك مستنقعات حيث تتواجد الكبريتيدات . كما جنس : G : Barchyarcus .
• خلايا منحنية رفيعة تجمع في رباعيات مسطحة أو مضاعفاتها ، متحركة ، تتواجد في رواسب المياه العذبة والملحة المحتوية على الكبريتيدات . لم يتم عزلها من مزارع فقيه وغير معروف تفاعلها مع صبغة جرام :
جنس G : pelosigma .
4- العصويات والكرويات السالبة لصبغة جرام .
Group 4 : Gram – Negative aerobic Rods and Cocci .
وتضم هذه المجموعة ثمانية عوائل Family أو فصائل وسنذكرها مع الأجناس التابعة لها وسنذكر نبذة مختصرة عن صفات كل عائلة :-
1- الفصيلة السيدوموناديه 1- Family : pseudomonad aceae .
وهي عصويات مستقيمة أو منحنية ، سالبة الجرام ، متحركة عادة بأسواط طرفية ، كيموعضوية التغذية هوائية ذات أيض تنفسي ، موجبة الكتاليز ، تنمو في المجال الحراري 54م أو أقل إلى 543م غير متجرثمة ، غير ذاتية التغذية . بعضها يسبب أمراض للإنسان والنبات . تنتشر أفراد هذه العائلة بدرجة واسعة بالطبيعة فهي توجد بالتربة أو بالمياه .
وتضم هذه العائلة أربعة أجناس :
G1: pseudomonas
G2: Xanthomonas
G3 : Zoogloea
G4 : Frateuria
ويعتبر الجنس الأول Pseudomonas هو الجنس النمطي لهذه الفصيلة Type Genus
2- العائلة أو الفصيلة الأزوتوباكتيريه . 2- Family : Azotobacteraceae
أفراد هذه العائلة تتراوح في مظهرها بين العصوية القصيرة والبيضية الكبيرة ، أنواعها تعيش حرة وتثبت النتروجين الجوي الجزيئي ، تعيش معيشة حرة بالتربة وهي هوائية إجباراً ، محركة ذات أسواط جسمية ، أو غير متحركة ، تنمو كيموعضوية التغذية ولا تحتاج إى عوامل نمو، بعض أجناسها تكون حويصلات . وتضم جنسين :
G1 : Azoto bacer .
G2 : Azomonas
3- العائلة الريزوبية 3- Family : Rhizobiaceae
الخلايا عصوية متحركة ( تتحرك بسوط واحد طرفي أو تحت طرفي أو تتحرك بأسواط جانبية(2– 6) هوائية ، سابة الجرام ، تشيد مواد هلامية على البيئات المحتوية على كربوهيدرات ، غير متجرثمة ، غير ذاتية التغذية ، قادرة على تثبيت النتروجين الجوي عندما تعيش نبادل منفعة أ ومعيشة تكافلية مع جذور البقوليات محدثة عقد في جذورها . وبعضها تصيب النباتات مسببة لها تورمات ولا تثبت النتروجين الجوي . وتضم أربعة أجناس يتم التمييز بينهما عن طريق أنواع النباتات التي تعيش معها معيشة تكافلية أو تسبب أمراض لها ، وقدرتها على تثبيت النتروجين الجوي والأجناس هي :
G1 : Rhizobium
G2 : Brdyrhizobium
G3 : Agrobacterium
G4 : phyllobacterium
4- العائلة الميثيلوكوكية 4 Family : methylococcaceae
أفراد عصوية ، كروية ، واويات ، قادرة على استغلال الميثان CH4 والميثانول Ch3 oH كمصدر وحيد للكربون والطاقة وذلك تحت الظروف الهوائية أو الميكروإيزوفيلية وتعرف بالبكتيريا المثيلية التغذية إجباراً وبعض أنواع هذه المجموعة تستطيع أيضاً استغلال المركبات الكربونية العضوية ومن ثم تعرف بالبكتيريا المثيلية التغذية اختباراً وتضم العائلة جنسين هما :
G2 : Methylomonas
G1 : Methylococcus
وعند استغلال هذه البكتيريا للميثان أو الميثانول تحتوي الخلايا توغلات غشائية داخلية معقدة ومعظم الأنواع تكون حويصلات . والأنواع المثالية للأجناس السابقة هما :
Methylococcus Capsulatus.
Methyiomonas Methanica .
5- الفصيلة الهالوبكتيرية 5 Family : Halobacteriaceae
وتضم أنواع البكتيريا المحبة للملوحة والخلايا كروية وعصوية الشكل وذات صفات تركيبية وفسيولوجية خاصة . التكاثر بالإنقسام الثنائي البسيط ، سالبة الجرام . هوائية اجباراً حيث تستعمل الO2 كمستقبل نهائي للألكترونيات . وتستعمل الميثان والفورمالوهيد كمصدر وحيد للكربون والطاقة . درجات الحرارة المثلى للنمو تتراوح بين 20-535م . النسبة المئوية للقواعد النتروجينية C + G 66-68% ، تتطلب بشدة كلوريد الصوديوم للنمو . وقد تم تصنيفها حديثاً ضمن البكتيريا الأولية . وهي إما متحركة أو غير متحركة وتضم الجنسين
G1 : Halobacterium .
G2 : Halococcus.
6- الفصيلة (العائلة) الأسيتوباكتيرية 6 Family ; Acetobacteraceae
سالبة أو متغيرة الجرام ، الخلايا صولجانية اشكل عصوية ، تتواجد منفردة أو مرتبة في أزواج أو سلاسل . متحركة بأسواط جسدية أو 1-8 أسواط طرفية ، أو غير متحركة ، هوائية ذات أيض تنفسي ، عادة موجبة الكتاليز( عدا نوعين ) سالبة الأوكسيديز . درجة الحرارة المثلى للنمو 25-530م ، وph المثلى 5-6 تؤكسد الإيثانول إلى حامض الخليك في البيئة الحامضية والمتعادلة . ولا تنتج الأندول . النسبة المئوية لل(C + G ) في الDNA 51-65% وتحتوي الفصيلة على جنسين :
G1 : Aceto bacter .
G2 : Gllucono bacter
الجنس الأول : يؤكسد اللاكتات أو حمض الخليك إلى ثاني أكسيد الكربون ، متحركة بأسواط جسدية أو غير متحركة .
الجنس الثاني : لا يؤكسد اللاكتات أو حمض الخليك إلى ثاني أكسيد الكربون ،متحركة بأسواط قطبية أو تكون غير متحركة.
7- الفصيلة الليجيونيللية 7 Family : Legionellaceae.
عصويات سالبة الجرام . لا تكون جراثيم داخلية أو حويصلات صغيرة . متحركة بسوط واحد أو أكثر من الأسواط الطرفية أو الجانبية ، تحتاج لنموها إلى السيستين وأملاح الحديد . لا تستطيع أكسدة أو تخمر الكربوهيدرات . تحلل الجيلاتين ولا تختزل النترات وسالبة الأوكسيديز واليورياز ودرجة الحرارة المثلى للنمو 25-530م الأنسب 5و5-6 ( معظمها تنمو في بيئات شديدة الحموضة pH 3.6 ) ممرضة للإنسان وبعضها يسبب التهاب رئوي للإنسان ونسبة ال(C+ G) في الDNA 39- 43% وتحوي العائلة جنس واحد :
وتستوطن أنواعه المياه السطحية وخاصة المناطق الموحلة والأنهار الملوثة
G1 : Legionlla
8- الفصيلة النيسيرية 8 Family: Leisseriaceae
الخلايا الكروية في أزواج أو في كتل أو عصويات في أزواج أو في سلاسل قصيرة ، غير مسوطة ،سالبة الجرام . بعض تكون اصباغ من Xanthephyll بعض الأنواع تحتاج إلى احتياجات غذائية معقدة بعد العزل مباشرة ولكن باستمرار وجودها في بيئة صناعية يمكن إقامتها في بيئات بسيطة معظم الأنواع تنتج الألماليز وسيتوكروم أو اكسيديز فهي هوائية .
تتطفل على الحيوانات ذات الدم الدافي فيما عدا الجنس اسيتوباكتر فهو غالباً مترمم يستوطن التربة والبيئات المائية . وتضم الأجناس التالية :
G1 : Neisseria
G2 : Moraxella
G3 : Acineto bacter
G4 : Kingella
والجنس الأول هي الأهم حيث أن بعض أنواعه تحلل كرات الدم الحمراء ، فهي تتطفل على الحيوانات والإنسان ومن أهم أنواع الجنس الأول والأنواع هي :
حيث يسبب مرض جنسي يسمى السيلان - Neisseria gonorrhoeae .
حيث يسبب مرض الإلتهاب السحائي ( الحمى الشوكية ) - Neisseria Meningiidi .
5- العصويات غير الهوائية اختياراً والسالبة الجرام
Group 5 : Gram . Negative Facultatively anaerobic Rods
أعضاء هذه المجموعة من أكبر المجاميع البكتيرية سالبة الجرام غير التمثيلية المدروسة جيداً لأهميتها الطبية وعلاقتها بكثير من الأمراض التي تصيب الإنسان والحيوان ، عصويات صغيرة مستقيمة أو منحنية لاتزيد عن 1/2 ميكروميتر في القطر ، بعضها غير متحرك ، والمتحرك منها جانبي الأسواط ، وقد تكون الأسواط قطبية أو مختلطة .
هذه المجموعة لا هوائية إختيارية ، وتحت الظروف اللاهوائية تحصل البكتيريا على الطاقة من تخمرالكربوهيدرا ت ،وتحت الظروف الهوائية تستغل المجموعة كثير من المواد العضوية في التنفس وتضم ثلاث فصائل :-
1- الفصيلة الأنتيروبكتيرية 1- Family : Entero bacteriaceae
وهي عصويات مستقيمة ، متحركة بأسواط جانبية أو غير متحركة . معلبة أو غير معلبة . كيمو عضوية التغذية والبعض تحتاج فيتامينات أو أحماض أمينية ، عادة تتحرك التترات إلى تتريت.
المستعمرات غير ملونة أو ملونة ( وردية إلى حمراء ) بغض الأجناس مترمم والبعض يسبب أمراض للإنسان والحيوانات ذوات الدم الدافيء ومنها الأسماك . واسعة الإنتشار في النباتات الطبيعية وتضم الأجناس :
G1 : Escherichia G2 : Edwardsiella G3 : Shigella G4 : Citro bacter
G5 : Salmonella G6 : Klebsiella G 7 : Hafnia G8 : Enterobacter
G9: Serratia G10 : Broteus G11: Yersinia G12 : Erwinia
G13: providencia
من الأنواع التابعة للجنس الأول :- .Escherichia Co li
= = = = الثالث: وتسبب الدوسنتاريا الباسيلية .Shigella alysenteriae - Sh . Shiga
= = = = الخامس : الحمى التيفية .S.typhosa - S . paratyphi -S .Typhimurum
= = = = الرابع : ويسبب الإلتهاب السحائي . Citrobacter dirersus
= = = = السادس : ومن أهم الأنواع . Klebsiella pneumonia
= = = = الثاني عشر : المسبب للذبول الوعائي .Erowinia stewartii
= = = = العاشر : . proteus vulgaris
2- الفصيلة الفبريونية 2 Family : Vibrionaceae
عصويات مستقيمة أو منحنية ، تتحرك بأسواط طرفية كيموعضوية التغذية ( عدد قليل يحتاج عوامل نمو ) ومعظم الأنواع تحتاج 2-35% Nad للنمو الأمثل . لا هوائية اختيارية ، لا تختزل النترات .
عادة تستوطن المياه وتكون مصاحبة للحيوانات ، وعديد من الأنواع ممرضة للإنسان والأسماك والضفادع وفقاريات ولا فقاريا أخرى وتضم الأجناس التالية :-
1. الجنس فبريو G1 : Vibrio
عصويات منحنية ، متحركة بأسواط . كيموعضوية التغذية ، قليل منها يحتاج عوامل للنمو ومعظم الأنواع تحتاج إلى Nad لنموها تضم أنواع تسبب أمراض للإنسان وهي : المسبب لمرض الكوليرا Vibrio Cholerae
2. الجنس فوتوباكتير G2 : Photobactrium
عصويات مستقيمة ، تتحرك بواسطة 1- 3 أسواط طرفية غير مغلفة بعضها غير متحركة . كيموعضوية التغذية . تستوطن البيئات البحرية والعض يتكافل مع الأسماك البحرية .
3. الجنس إيروموناس G3: Aeromonas
عصوية مستقيمة إلى كروية الشكل . تتحرك بسوط طرفي ونوع واحد غير متحرك . تختزل النترات وهي كيمو عضوية التغذية ، تستوطن المياه العذبة ومياه الصرف الصحي . بعض الأنواع ممرض للأسماك والضفادع .
4. الجنس بليزيوموناس G4 : Plesiomons
عصويات مستقيمة متحركة بأسواط طرفية ، كيموعضوية التغذية تتواجد على الأسماك والحيوانات المائية بعض السلالات تسبب إسهال للإنسان .
3-الفصيلة الباستيريللية 3 Family : Pasteurellaceae
خلايا عصوية إلى كروية الشكل وقد تتعدد الأشكال تبعاً لعمر المزرعة والعوامل البيئية ، سالبة الجرام ، غير متحركة ، هوائية ولا هوائية اختيارية . وسطية الحرارة . كيموعضوية تنمو على الأوساط الغذائية المعقدة التركيب، تختزل النترات إلىنتريت ، موجبة الكتاليز والأوكسديز ، تتطفل على الفقاريات وخاصة الثدييات ( ومنها الإنسان ) والطيور ومعظم الأنواع الممرضة تحتوي على علبة أنتيجينية . وتضم ثلاثة أجناس :
G1 : Pasteurella
G2 : Actinobacillus
G3 : Haemophilus
6- العصويات غير الهوائية والسالبة لجرام
Group 6 : Anaerobic Gram – negative Striaght
بكتيريا لاهوائية اجبارية ، سالبة الجرام . عصويات مستقيمة أو منحنية أو حلزونية ، متحركة أو غير متحركة وهي كيموعضوية تخمر الكربوهيدرات ، وتضم عدد من الأجناس يمكن التمييز بينها تبعاً للصفات المورفولوجية والفسيولوجية ( المدى الحراري للنمو – شكل الخلايا – الحركة وترتيب الأسواط – نوعية الأحماض الناتجة عن الأيض التخمري . والأجناس التابعة لها هي :-
G1 : Bacteroides G2 : Fusibacteriuim G3 : Succinimonas
G4 : Selenomonas G5 : Butyrivibrio G6 : Leptotrichia
G7 : Succinivibrio G8 : Anaerob G9 : Aceptotrichia
G10: Pectinatus G11:Anaerovibrio G12: Asporomus
G13: Lachnospira G14: Haloanaerobium G15:Halobacteroides
G16: Megamonas G17: Welinella G18: Themobacteroides
وهذه الأجناس السابق ذكرها تتجمع في عائلة وهي : Family : Bacteroidaceae
7- البكتيريا الممثلة للكبريتات والمختزلة للكبريت
Group 7: Dissimilatory Sulfate – or – s . Reducing
أفراد هذا القسم غير هوائية اجباراً وسالبة الجرام . تستخدم السلفات ومركبات كبريت أخرى مؤكسدة كمستقبل للألكترونات ، تحتوي الخلايا على سيتوكرومات من النوع C أو B أو الإثنين معاً ، ويضم القسم ثمانية أجناس : -
1. يؤكسد الستيتات إلىCo2 ويستخدم S كمستقبل للألكترونات ولاتختزل السلفات مطلقاً.
G1: Desulfuromonas.
2. يؤكسد اللاكتات إلىCo2 وبعضها تستخدم الحماض الدهنية بعد أكسدتها أكسدة كاملة .
G2: Desulfovibrio
3. يؤكسد البيروفيك أكسدة غير كاملة إلى استيات وCo2 .
G3: Desulfomonas.
4. قادر على أكسدة الحماض الدهنية أو البنزوات أكسدة كاملة .
G4: Desulfococcus.
5. يؤكسد الأستيتات أكسدة تامة إلى Co2 وينمو في مياه البحر .
G5: Desulfobacter.
6. يقوم بأكسدة غير كاملة للببتون أو الأكتات إلى أستات وCo2
G6: Desulfobulbus.
7. جميع أنواعه قادرة على تكوين جراثيم داخلية .
G7: Desulfotomaculum.
8. تؤكسد الأحماض الدهنية أو النترات أكسدة كاملة .
G8: Desulfosarcina.
9. تؤكسد الأحماض الدهنية كاملاً.
G9: Desulfonama.
- الجنس السابع يصنف تحت المجموعة الأولى –Subgroup 1
- الجنس الثاني والثالث والسادس تحت المجموعة الثانية – Subgroup 2
- الجنس الخامس والرابع والتاسع والثامن تحت المجموعة الثالثة . _Subgroup 3
- الجنس الأول تحت المجموعة الرابعة _Subgroub 4
8- البكتيريا الكروية اللاهوائية السالبة لجرام
: Group 8 : Anaerobic Gram – Negative cocci.
المجموعة خلايا كروية تترتب في ازواج ، غير متحركة سالبة الجرام اجبارية لاهوائية . سالبة الأكسيديز والكتاليز. كيموعضوية التغذية ذات احتياجات غذائية معقدة . تخمرأو لا تخمرالكربوهيدرات . فتطفل على بعض الحيوانات ومنها الإنسان . ويتبع المجموعة عائلة واحدة هي :
Family : Veillonellaceae
ويتبعها جنس واحد وجنسين آخرين أي ثلاث أجناس .
G1: Voillonella
G2 : Acidaminococcus
G3: Megasphaera
حيث يتميز الجنس الأول بتطفله على الإنسان والحيوان فهو يتواجد في الفم والقنوات المعوية والتنفسية للإنسان والحيوان .
وسمي الجنس الثاني بهذا الإسم لأنه يفضل الأحماض الأمينية كمصدر وحيد للكربون والطاقة وخاصة الجلوتاميد .
9- الركتسيات والكلاميدات
Group 9: Rickttsias and Chlamydias
ويضم هذا الجزء رتبتين :-
1- رتبة الركتسيالات Order : Richettsiales
2- رتبة الكلاميديات Order : Chlamydiales
1- رتبة الركتسيالات Richettsiales
معظم الأنواع عصوية الشكل أو كروية أو متعددة الأشكال ، عديمة الأسواط ، سالبة الجرام اجبارية التطفل على الفقاريات ( تسبب العديد من أمراض الحمى ) وتنقسم داخل خلايا العائل بواسطة الإنقسام الثنائي . يمكن تثمينها على بيئات معملية مثل بيئات آجار الدم blood agar وتكون المفصليات أحد نواقل هذه الأمراض فهي العائل الأولي وتشمل ثلاث فصائل هي تحت عائلة Rickettsiaceae
Tribe1- Rickettsieae Tribe2- Ehrlichieae Tribe 3- Wolbachieae
2- رتبة الكلاميديات Chlamydiacea
طفيليات اجبا رية لا تنموعلى البيئات الصناعية ، لاتنقلها اللافقاريات أي تكون العدوى بالإتصال المباشر تنقسم الإنقسام الثنائي . كروية الخلايا . غير متحركة . سالبة الجرام
وتضم عائلة واحدة :- Family : Chlamydiacea
وتضم جنس واحد G1 : Chlamydia
والذي يمتلك نوعين هما : C . Trachomatis الذي يسبب مرض التراكوما عند الإنسان والطيور
C . Psitiaci والذي يصيب الإنسان والطيور أيضاً .
10- الميكوبلازما
Group 10 : Mycoplasmas
Division : Tenericutes
Class : Mollicutes
Order : Mycoplasmatale
وتعتبر الميكوبلازما أصغر الكائنات الحية حجماً وتختلف عن البكتيريا الأخرى في غياب الجدار الخلوي ، فهي بذلك لا تصبغ بصبغة جرام . ذات أشكال مختلفة .وخلايا ذات قطر يتراوح بين 150-300 nm تتكاثر بتكوين جزئيات أولية صغيرة تصعب قياسها ويمكنها أن تمر خلال المرشحات البكتيرية ذات الثقوب الدقيقة ( بقطر 150 nm ) .
تحتوي هذه الرتبة على ثلاث عائلات وسنذكرها فيما يلي بإختصار والأجناس التابعة لها :
• يتطلب نمو هذه الأفراد التابعة لها و جود Sterols
1-Family : Mycoplasmataceae
وهذا الجنس سالب لأختبار اليورياز Urcase . G1: mycoplasma
= = موجب = = = . G2: Ureaplsma
• لاتتطلب لنموها وجود Sterols حيث تخلق الأحماض الدهنية
2- Family :Acholeplasmatacea
من الأسيتات وتمتلك dehydrogenases G1 : Acholeplasma Laric
• تحتاج إلى Sterols وتمتلك نظامe Phosphotrasf
3-Family : Spiroplasmataceae
من مهاجمتها للجلوكوز . تحوي جنس واحد G1: Spiroplasma
كما أن خلاياها ملتوية ( حلزونية الشكل )
11- بكتيريا تعيش داخل العائل معيشة تبادلية المنفعة
Group11 : Endosymbionts
يعتبر معيشة تبادل المنفعة شائعاً بين البروتوزوا والبكتيريا والفطريات والطحالب ويبدو أن هذه الأفراد تتأقلم على هذه الطريقة من المعيشة إذا ما توفرت البيئة المناسبة وتوجد علاقة وطيدة بين الكائنات تبادلية المنفعة وعوائلها . ولم تعرف ميكانيكية هذه العلاقة .
وعلى الرغم من أن هذه الكائنات ليست ضارة لعوائلها إلا أنه في بعض الحالات وتحت ظروف بيئية معينه يمكن أن تكون ضارة .
12- البكتيريا الكروية الموجبة الجرام
Group 12 : -Postive Cocci
تضم المجموعة اجناس تتماثل في بعض الصفات المورفولوجية ( كرويات موجبة الجرام ) والفسيولوجية ( كيموعضوية التغذية ، ميزوفيلية ، غير متجرثمة ) ويمكن التمييز بينها تبعاً لاحتياجاتهم من الأكسجين ( بعض الأجناس هوائية اجبارية ، والبعض لاهوائية اختيارية والبعض الآخر لاهوائية (إجبارية ) ونوعية تجمعاتالخلايا وأيضاً قدرتها على تشييد الكتاليز : وتضم المجموعة عائلتين وسنذكرها مع ذكر بعض الأجناس التابعة لها :
العائلة الأولى : 1 Family : Micrococcaeae
- وهي هوائية موجبة الكتاليز G1 : Micrococcus
- وهولاهوائية اختيارية وبعضها موجبة الكتاليز G2 : Staphylococcus
- والبعض الآخر سالب الكتاليز والنوع المثالي للجنس الثاني هو : Staph . aureus
- وهو المسبب لمرض التسمم الغذائي .
ويتبع هذه العائلة جنسين آخرين هما : G3: Planococcus
G4: Stamato coccus
العائلة الثانية : 2 Family : Deinococcaceae
كرويات مرتبة في أزواج أو سلاسل طويلة أوقصيرة G1: Streptococcus
بعضها تكون علبة أو كبسولة . وتخمر السكريات وينقسم الجنس أو يضم أنواع ممرضة منها (المسبب للإلتهاب الرئوي )
والذي تم تقسيمه إلى ثلاثة انماط على أساس تحليل للدم
St . pneumoniae تحليل كامل للدم .
B . haemolytic تحليل غير كامل للدم .
B.oc. haemolytic لا يحدث تحلل للدم .
خلاياه كروية الشكل يمكن للجنس هذا أن يخمر الجلوكوز مع تكوين كمية من الأحماض وكحول الإيثايل وتتواجد طبيعياً في اللبن والعصارات النباتية . G2 : leuconostoc
(النوع المثالي ) L . mesenteroides
13- العصويات والكرويات الموجبة لجرام والمتجرثمة .
Group13: Endospore –forming Gram – Postive Rods and cocci .
وتضم البكتيريا المكونة للجراثيم الداخلية ( عادة جرثومة واحدة داخل الخلية ) وهي تمثل طور من أطوار الحياة ونادراً ما يكون أن تمثل وسيلة تكاثرية . وهي كرويات وأخرى عصويات هوائية لاهوائية اختيارية . متحركة والبعض للإنسان والحيوان وتضم عدة أجناس :-
G1 : Bacillus
وهو المسبب لمرض الجمرة الخبيثة B . anthracis
B .Thuringiensis . B. Larvae . B . Lentimorbus B . popiliae
أما الأجناس الأربعة الأخيرة فلها دور في المقاومة البيولوجية للحشرات . ولها نفس الصفات السابقة للمجموعة ولكن تحتاج إلى حفظ قليل من الأوكسجين ولا تحوي الكتاليز . ومن أنواعها :
G2: Sporolactobacillus
S . inuliaus
- وهي تعتبر لاهوائية اجباراً ومنها أنواع ممرضة للإنسان G3: Clostridium
- والمسبب لمرض التيتانوس ( الكزاز ) Clostridium tetani
- والمسبب للتسمم الغذائي والذي قد يؤدي إلى الوفاة Clostridium botulinum
- وجد في التربة والقناة الهضمية للإنسان والحيوان butyricum Clostridium
G4: Desulfotomaculum .
G5: Sporosarcina.
G6: Oscillospira
G7: Amphibacillus.
G8: Sporolactobacillus .
G9:Syntrophispore
G10: Sporohalobacter
G11: Sulfobacillus
14- البكتيريا العصوية غير متجرثمة والموجبة لجرام
Group 14: Nonsporing Gtve Rods.
مجموعة من البكتيريا : تتماثل في بعض صفاتها المورفولوجية والفسيولوجية ، الخلايا عصوية ( احياناً كروية إلى عصوية طويلة إلى خيطية ) موجبة الجرام ، لاتكون جراثيم داخلية ، غير ملونة ( البعض يشيد أصباغ تنتشر في البيئة ) وسيطة الحرارة ، كيمو عضوية التغذية عادة غير متحركة والبعض متحرك عن طريق أسواط جسمية ، سالبة الكتاليز . وهي تضم سبعة اجناس :-
1-الحمض الثنائي الأمين في اليثيدوجليكان هو G1: Lactobacillus . Ornitlue , DAP ,Lysine
ويتواجد على اسطح النباتات ومنتجات الألبان ، تجمر السكريات وتقوم بتخمر لاكتيلي 0 حمض اللاكتيك فقط) وتعرف الأنواع بأحادية التخمر أو تخمر لاكتيكي مختلط ( حمض لاكتيك + خليك + كحول + Co2 ) والأنواع هي :
آحادية التخمر homo fermenters ثنائية أو مختلطة التخمر hetero fermenters
L . Casei L . acidophilus L . breuis L . buchneri
L . plantarum L .bulgraricus L . fermenti L . Thermophilus
2- الحمض الأميني في البيثيدوجليكان هو M.DAP البعض ممرض للماشية G2: Listeria
مثل النوع المثالي : L . monocytogenes.
3-الحمض الأميني في اليثيدوجليكان هوLysine G3: Caryophanon .
وعادة يوجد على براز البقر وهو غير ممرض والنوع المثالي C . Lactum
4- الحمض الأميني الثنائي في اليثيدوجليكان هو Lysine G4; Erysipelothrix .
وهو ممرض للفقاريات ومنها المسبب لمرض في الخنازير وهو النوع E . rhusiopathiae.
5-الحمض الأميني الثنائي في اليثيدوجليكان هوLysine والأول غير مرض G5: Kurthia.
6- = = = = = = = ممرض لسمك السلمون G6:Renibacterium .
7- الحمض الثنائي الأمين في اليثيدوجليكان M .DAP يتواجد على منتجات G7:Brochothrix .
اللحوم وهو غير ممرض .
15- العصويات الموجبة الجرام غير متجرثمة وغير منتظمة .
Group15: Irregular